一种以测序为基础的基因分型方法的建立

被引：5

作者：

刘泽寰

林蒋海

符志彦

潘德京

徐安龙

机构：

[1] 中山大学生命科学学院

来源：

中山大学学报(自然科学版) | 2001年 / 05期

关键词：

基因分型; 基于序列的分型; 测序; HLA-DPB1;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q523 [脱氧核糖核酸（DNA）];

学科分类号：

摘要：

设计了一种自动化的基因分型方法，能够直接利用ＰＣＲ产物的ＤＮＡ测序结果作为数据，通过自动化基因分型程序（ａｕｔｏｍａｔｉｃｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇｐｒｏｇｒａｍ）与一个含有其等位基因序列的数据库进行比较，来完成高精度的基因分型工作．用这种方法对５０个随机挑选的中冈南方人的ＨＬＡ－ＤＰＢ１基因进行广基因分型，证明该方法是可行的，并从中发现了２个不明确杂合子以及一个新的等位基因序列．随后对这些样品克隆测序，发现除了２个不明确杂合子得到了进一步的区分外，其它样品都与前面的分型结果一致，显示了９６％的精确性．通过以上的研究表明，成功建立了一种高精度的、基于序列的分型（ｓｅｑｕｅｎｃｅ－ｂａｓｅｄ　ｔｙｐｉｎｇ）方法．既然该方法能成功分型ＨＬＡ－ＤＰＢ１基因，预示了该方法同样能应用于其它基因的分型．该ＡＧＰ程序可以在ｈｔｔｐ：／ｇｅｎｏｍｅ．ｚｓｕ．ｅｄｕ．ｃｎ免费下载．

引用

页码：83 / 87

页数：5

共 10 条

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