鼠疫耶尔森菌菌株91001的蛋白质组学初步研究

被引:5
作者
宋亚军
童宗中
王津
郭兆彪
汪莉
韩延平
裴德翠
周冬生
王敬强
李晓雷
祁芝珍
金丽霞
戴瑞霞
李敏
翟俊辉
杜宗敏
王效义
杨焕明
汪建
黄培堂
杨瑞馥
机构
[1] 军事医学科学院微生物流行病研究所
[2] 中国科学院北京基因组研究所
[3] 军事医学科学院生物工程研究所
[4] 青海省地方病预防控制所
[5] 军事医学科学院微生物流行病研究所 北京
[6] 北京
关键词
耶尔森氏菌,鼠疫; 蛋白质组;
D O I
暂无
中图分类号
R346 [];
学科分类号
摘要
目的 建立鼠疫耶尔森菌的蛋白质组学研究方法 ,获得鼠疫耶尔森菌的基本蛋白质组数据。方法 以对人无致病能力的布氏田鼠疫源地菌株 910 0 1为研究对象 ,按照溶解性的不同分别收集菌体蛋白 ,以 3种不同方法 (Shotgun LC MS MS ,1D LC MS MS和2D MS)进行分析 ,将分析数据与基于 910 0 1菌株基因组全序列建立的蛋白质理论数据库进行比对 ,确定 910 0 1菌株本实验培养条件下所表达的蛋白组分。结果 Shotgun LC MS MS方法鉴定了 971种蛋白 ,1D LC MS MS鉴定了 915种 ,而 2D MS方法则鉴定了 2 33种蛋白质 ,三者合计为 1193种蛋白质 ,占基因组预测CDS的 2 8 7% (1193/414 3)。结论 不同的蛋白质组分析方法鉴定的蛋白质种类和数目都存在差异 ,为更全面地获得鼠疫耶尔森菌蛋白质组数据 ,有必要同时采取多种方法进行分析。
引用
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