汉坦病毒Z10株M片段全基因序列分析

目的　测定我国疫苗株Z10的M片段全基因序列 ,了解其分子基础 ,并分析其与其它汉坦病毒株的遗传学差异。方法　从Z10株病毒感染的细胞提取总RNA ,将逆转录PCR扩增的产物纯化后克隆于T载体并进行序列测定 ,应用DNASTAR软件分析比较。结果　Z10株M片段的全基因序列共 36 15个核苷酸 ,四种核苷酸的比例分别为A 30 15 % ,T 2 9 41% ,G 2 1 72 % ,C 18 73%。以第二种读码方式推导出其最大读码框架从 41到 34 48,共编码 1135个氨基酸。序列同源分析表明 ,Z10株与HTN型核苷酸同源性为 83 6 %～ 87 4% ,与SEO ,DOB和Thai型为 6 9 5 %～ 70 8% ,而与PUU和HPS各型病毒同源性仅为 5 7 6 %～ 5 9 9%。氨基酸同源分析Z10株与HTN型同源性高达 94 2 %～96 0 % ,与SEO ,DOB和Thai型为 73 3%～ 76 6 % ,而与PUU和HPS各型病毒同源仅为 5 3 2 %～5 6 3%。绘出了核苷酸和氨基酸的系统发生树。结论　Z10株为不同于已报告M片段全基因序列的HTN型国内外毒株的另一亚型 ,并具有 16个独特的氨基酸。