红树林土壤细菌群落16SrDNAV3片段PCR产物的DGGE分析

被引:63
作者
王岳坤
洪葵
机构
[1] 中国热带农业科学院热带生物技术研究所
[2] 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 海口中国热带农业科学院橡胶研究所儋州
[3] 海口
关键词
红树林土壤; 16SrDNA; DGGE;
D O I
10.13343/j.cnki.wsxb.2005.02.009
中图分类号
S714.3 [森林土壤生物学];
学科分类号
0903 ; 090301 ;
摘要
从土壤中抽提微生物总DNA ,直接扩增 16SrDNAV3片段 ,应用变性梯度凝胶电泳 (DGGE)和分子克隆技术分析 16SrDNAV3片段的多态性 ,发现地域因素和红树品种都是影响土壤细菌群落结构的因素。通过对杯萼海桑土壤 16SrDNAV3片段PCR产物两个DGGE条带进行分子克隆、序列测定和Blast分析 ,发现每个DGGE条带包含着许多不同的 16SrDNAV3片段 ,并且其中多数为NCBI未收录的序列。这表明DGGE和克隆技术相结合的方法是研究土壤微生物群落结构的一种可行方法。
引用
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