高产水稻土细菌多样性的培养法与非培养法比较研究

被引:9
作者
崔中利 [1 ,2 ]
刘娟 [2 ]
曹慧 [2 ]
骆永明 [1 ]
赵其国 [1 ]
机构
[1] 中国科学院南京土壤研究所
[2] 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
关键词
水稻土红壤; 平板培养细菌; 16S rDNA克隆文库; ARDRA; 多样性指数;
D O I
10.13758/j.cnki.tr.2008.06.023
中图分类号
S154.3 [土壤微生物学];
学科分类号
摘要
利用细菌的通用引物扩增江西余江县高产水稻土红壤细菌总DNA和平板培养细菌混合总DNA的16S rDNA基因片段,在此基础上分别建立两种16S rDNA文库(文库a和文库b)。从两个文库中各随机挑选100个克隆,扩增出阳性克隆中的插入片段后选用HhaⅠ和RsaⅠ两种四碱基酶进行ARDRA(amplified rDNA restriction analysis)分析。统计比较分析发现,文库a的Shannon-Wienner指数、Simpson指数、丰富度、均一度分别为4.432、0.987、18.885和0.973,均高于文库b中相应的多样性参数(分别为2.271、0.758、5.736和0.501),即平板培养方法所展现的细菌群落结构多样性低于土壤中原始的多样性。结果表明,传统培养方法存在着很大的局限性,必须结合新的分子生物学技术手段才能更全面完善地认识土壤微生物群落结构多样性,以期充分利用其中丰富的微生物资源。
引用
收藏
页码:903 / 908
页数:6
相关论文
共 11 条
[1]   江西余江县高产水稻土有机碳和养分含量变化 [J].
李忠佩 ;
张桃林 ;
陈碧云 .
中国农业科学, 2006, (02) :324-330
[2]   不同森林恢复类型对土壤微生物群落的影响 [J].
郑华 ;
欧阳志云 ;
王效科 ;
方治国 ;
赵同谦 ;
苗鸿 .
应用生态学报, 2004, (11) :2019-2024
[3]   未培养微生物的研究与微生物分子生态学的发展 [J].
叶姜瑜 ;
罗固源 .
微生物学通报, 2004, (05) :111-115
[4]   不同土地利用方式对红壤微生物多样性的影响 [J].
姚槐应 ;
何振立 ;
黄昌勇 .
水土保持学报, 2003, (02) :51-54
[5]   红壤微生物生物量C周转及其研究 [J].
陈国潮 ;
何振立 ;
黄昌勇 .
土壤学报, 2002, (02) :152-160
[6]  
土壤微生物学[M]. 中国农业出版社 , 李阜棣主编, 1996
[7]  
分子克隆实验指南[M]. 科学出版社[美]萨姆布鲁克(Sambrook,J·)等 著, 1992
[8]   New approaches to analyzing microbial biodiversity data [J].
Bohannan, BJM ;
Hughes, J .
CURRENT OPINION IN MICROBIOLOGY, 2003, 6 (03) :282-287
[9]   Using ecological diversity measures with bacterial communities [J].
Hill, TCJ ;
Walsh, KA ;
Harris, JA ;
Moffett, BF .
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, 2003, 43 (01) :1-11
[10]   EVALUATION OF THE APPLICABILITY OF AMPLIFIED RDNA-RESTRICTION ANALYSIS (ARDRA) TO IDENTIFICATION OF SPECIES OF THE GENUS CORYNEBACTERIUM [J].
VANEECHOUTTE, M ;
RIEGEL, P ;
DEBRIEL, D ;
MONTEIL, H ;
VERSCHRAEGEN, G ;
DEROUCK, A ;
CLAEYS, G .
RESEARCH IN MICROBIOLOGY, 1995, 146 (08) :633-641