芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较

基于ITS序列和脂肪酸鉴定方法对从土壤中分离得到的16株芽胞杆菌进行分类研究,与分子鉴定结果相比,脂肪酸种的鉴定准确率可达到99%以上。通过生物软件SPSS和Mega分别对16株菌进行聚类分析,结果表明,脂肪酸比ITS更适合于芽胞杆菌的分类研究,根据脂肪酸成分可以将16株芽胞杆菌准确聚在一起,而ITS则不能。芽胞杆菌特征性脂肪酸为15∶0ANTEISO和15∶0ISO,但不同种芽胞杆菌的此类脂肪酸含量不同。对芽胞杆菌3大类菌群主要特征性脂肪酸的含量比例(15∶0ISO/15∶0ANTEISO)进行了分析,其中比较特殊的为蜡状芽胞杆菌类群,蜡状芽胞杆菌主要脂肪酸为15∶0ISO,其次为13∶0ISO,而15∶0ANTEISO的含量很低,而且不是主要类型,15∶0ISO/15∶0ANTEISO的比值约为5.6～7.9。简单芽胞杆菌群主要脂肪酸为15∶0ANTEISO和15∶0ISO,15∶0ISO/15∶0ANTEISO比值约为1/6。巨大芽胞杆菌类群主要脂肪酸15∶0ISO和15∶0ANTEISO含量相近,其余脂肪酸远远低于这2种主要脂肪酸。巨大芽胞杆菌的15∶0ISO/15∶0ANTEISO的比值约为4/5～5/4,菌株FJAT-4500为短小芽胞杆菌,其15∶0ISO/15∶0ANTEISO比值约为2。短小芽胞杆菌和巨大芽胞杆菌归为一类是因为其脂肪酸类型相近,但含量并不同。枯草芽胞杆菌群主要脂肪酸15∶0ISO的含量小于15∶0ANTEISO,15∶0ISO/15∶0ANTEISO的比值为1/3～2/3。