镉胁迫下稻田土壤微生物基因多样性的DGGE分子指纹分析

被引:36
作者
段学军
闵航
机构
[1] 浙江大学生命科学学院
关键词
镉胁迫; 稻田土壤; 基因多样性; DGGE分子指纹;
D O I
10.13227/j.hjkx.2004.05.027
中图分类号
S154.3 [土壤微生物学];
学科分类号
摘要
采用现代分子生物学技术 ,避开传统的分离培养过程 ,探讨重金属镉污染条件下稻田土壤微生物种群的基因多样性 .经过直接从土壤中抽提总DNA ,并对总DNA中 1 6SrDNA及其中V3可变区序列作PCR扩增、变性梯度凝胶电泳 (DGGE)分析等 ,对镉胁迫下稻田土壤总DNA、微生物种类分布进行了初步的研究 ,发现不同浓度镉胁迫下稻田土壤间的菌种有明显差异 ,DGGE技术可以用于污染环境下微生物多样性研究 .同时对DGGE分子指纹图谱的生物信息学分析作了初步尝试 ,为污染环境下土壤微生物多样性研究提供了新的实验方法与依据
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