犬瘟热病毒小熊猫株附着蛋白基因的序列分析

被引：11

作者：

何洪彬

李金中

夏咸柱

黄耕

邱薇

余春

范泉水

机构：

[1] 解放军农牧大学军事兽医研究所!长春

[2] 解放军农

来源：

中国预防兽医学报 | 1999年 / 06期

关键词：

小熊猫; 犬瘟热病毒; 附着蛋白基因; 序列分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

S852.65 [家畜病毒学];

学科分类号：

090601 ;

摘要：

为了从基因水平上研究我们分离的犬瘟热病毒（CDV）。熊猫（LP）毒株与疫苗弱毒Onderstepoort株的差别，本文对LP毒株附着蛋白（H）基因进行了序列测定。我们设计合成了4对引物，对LP株进行了RT-PCR扩增，将扩增得到的4个阳性PCR片段纯化后，直接进行测序，把所测序列拼接后，去掉侧翼的F基因和L基因序列，得到了H蛋白的全基因序列，该基因全长为1946bp，开放阅读框架（ORF）始于21-23位的ATG，终止于1842-1844位的TGA，编码607个氨基酸。将LP毒株与GenBank中疫苗弱毒Onderstepoort株进行比较，二者H基因核苷酸序列的同源性为92％，推导的H蛋白氨基酸序列的同源性为90％。Onderstepert株的H蛋白潜在的N-联糖基化位点为4个，其中2个位于N末端2／3处（一个位于推测的胞质部分，不能利用），另2个位于蛋白质C末端1／3处，而LP株H蛋白潜在的队联糖基化位点为8个，其中4个与Ondersttepoort的N-联糖基化位点完全相同，但另外4个是疫苗株所不具有的，糖基化位点的不同可能对LP株H蛋白的抗原性产生影响;两个毒株H蛋白的丰胱氨酸残基数目均为12个且位置是保守的;疏水性有一定的变化，但推测的穿膜区位置是相同的，约位于35-55位氨基酸之间。上述结果表明LP和Onderstepoort疫苗株的H蛋白及其基因是存在差别的，至

引用

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