氨基酸结构描述子矢量VHSE及其在肽QSAR中的应用

被引:23
作者
梅虎
周原
孙立力
李志良
机构
[1] 重庆大学生物工程学院,重庆大学生物工程学院,重庆大学生物工程学院,重庆大学生物医学工程教育部与重庆市重点实验室重庆大学生物医学工程教育部与重庆市重点实验室,重庆大学化学化工学院重庆,重庆大学生物医学工程教育部与重庆市重点实验室,重庆大学生物医学工程教育部与重庆市重点实验室,重庆大学化学化工学院重庆
关键词
氨基酸; 肽; 定量构效关系; 主成分分析; 偏最小二乘; 逐步回归;
D O I
10.14159/j.cnki.0441-3776.2005.07.009
中图分类号
O629.7 [α-氨基酸、肽类、蛋白质、核酸];
学科分类号
070303 ; 081704 ;
摘要
从20种天然氨基酸的50个物化性质出发,按照疏水、立体和电性特征将其分类后分别进行主成分分析,并将产生的得分矢量即VHSE(principalcomponentscorevectorofhydrophilicity,steric,andelectronicproperties)作为氨基酸结构描述子用于肽的定量构效关系研究。与已有方法相比,VHSE描述子具有物化意义明确、结果更易解释等特点。应用该描述子并结合逐步回归变量筛选和偏最小二乘建模方法,在对苦味二肽和血管舒缓激肽促进剂等体系的定量构效关系研究中,均取得了优于已有文献的结果。
引用
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共 1 条
[1]   STATISTICAL-ANALYSIS OF THE PHYSICAL-PROPERTIES OF THE 20 NATURALLY-OCCURRING AMINO-ACIDS [J].
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