转基因鱼试验湖浮游生物群落DNA多态性与物种组成关系

被引:5
作者
李学梅 [1 ,2 ]
余育和 [1 ]
冯伟松 [1 ]
颜庆云 [1 ,2 ]
吴利 [1 ,2 ]
张翔 [1 ,2 ]
机构
[1] 中国科学院水生生物研究所
[2] 中国科学院研究生院
关键词
DNA多态性; RAPD; PCR-DGGE; 浮游生物群落; 转基因鱼试验湖;
D O I
暂无
中图分类号
Q3 [遗传学];
学科分类号
071007 ; 090102 ;
摘要
采用RAPD和PCR-DGGE指纹技术对转基因鱼试验湖的浮游生物群落DNA多态性进行了研究,并探讨了DNA多态性与物种组成的关系.结果显示:(1)形态学分类共鉴定到44种/类浮游生物:其中藻类13种,原生动物11种,轮虫16种,枝角类和桡足类各2种.多甲藻(Peridinium sp.)、球形砂壳虫(Difflugia globulosa)、螺形龟甲轮虫(Keratella cochlearis)和针簇多肢轮虫(Polyarthra trigla)4个物种在各个站丰度相对较高.(2)RAPD扩增共获得128条长度在200-1200bp的谱带,多态率为61.7%,特异性谱带占总谱带的19.5%.(3)PCR-DGGE指纹分析共获得87条扩增谱带,其中原核生物谱带相对较多(50条),真核生物谱带较少(37条),多态率分别为86%和64.9%.尽管形态学鉴定和DNA指纹分析都表现出较高物种多样性,但其相似性聚类却有差别:物种组成聚类中B、C站聚为一类,D、E站聚为一类,A站独为一类;两种DNA指纹分析聚类结果显示C、D、E三站聚为一类,A、B聚为一类.综上所述,在对浮游生物群落的研究中,形态学方法与DNA指纹技术不显著对应,后者能揭示更丰富的物种多样性,但毫无疑问三种方法可以从不同方面表征群落结构.这将为进一步研究湖泊浮游生物群落结构和功能关系奠定坚实的基础.
引用
收藏
页码:375 / 381
页数:7
相关论文
共 14 条
[1]   大型深水贫营养水库——新丰江水库浮游动物群落分析 [J].
赵帅营 ;
韩博平 .
湖泊科学, 2007, (03) :305-314
[2]   转基因鱼试验湖浮游生物群落DNA指纹拓扑结构与优势种的关系 [J].
颜庆云 ;
舒少武 ;
冯伟松 ;
胡炜 ;
宋碧玉 ;
汪亚平 ;
余育和 .
自然科学进展, 2006, (07) :889-893
[3]   洞庭湖浮游生物群落DNA指纹拓扑结构与物种组成对应关系 [J].
颜庆云 ;
余育和 ;
冯伟松 .
生态学报, 2005, (09) :2221-2226
[4]   长江口邻近水域浮游动物群落特征及变动趋势 [J].
徐兆礼 .
生态学杂志, 2005, (07) :780-784
[5]   DNA指纹分析技术在群落级生命系统应用的可能性 [J].
余育和 ;
张文静 ;
颜庆云 ;
不详 .
水生生物学报 , 2004, (05) :457-463
[6]   转基因鱼离市场还有多远 [J].
朱作言 ;
曾志强 .
生物技术通报, 2000, (01) :4-9
[7]  
Plankton community composition in the Three Gorges Reservoir Region revealed by PCR-DGGE and its relationships with environmental factors[J] . Qingyun YAN,Yuhe YU,Weisong FENG,Zhigang YU,Hongtao CHEN.Journal of Environmental Sciences . 2008 (6)
[8]  
Spatiotemporal heterogeneity of plankton communities in Lake Donghu, China, as revealed by PCR–denaturing gradient gel electrophoresis and its relation to biotic and abiotic factors[J] . Yuhe Yu,Qingyun Yan,Weisong Feng.FEMS Microbiology Ecology . 2008 (3)
[9]   Genetic diversity of plankton community as depicted by PCR-DGGE fingerprinting and its relation to morphological composition and environmental factors in lake donghu [J].
Yan, Q. Y. ;
Yu, Y. H. ;
Feng, W. S. ;
Deng, W. N. ;
Song, X. H. .
MICROBIAL ECOLOGY, 2007, 54 (02) :290-297
[10]   DNA polymorphism of the plankton community and its relationships to species composition in the Three Gorges Reservoir Region of the Yangtze River [J].
Yan, Qingyun ;
Yu, Yuhe ;
Feng, Weisong ;
Zhang, Wenjing .
JOURNAL OF FRESHWATER ECOLOGY, 2006, 21 (03) :385-390