不同16SrDNA靶序列对DGGE分析活性污泥群落的影响

被引：60

作者：

邢德峰 ^{[1
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任南琪 ^{[1
]}

宋佳秀 ^{[1
]}

曲敏 ^{[2
]}

徐香玲 ^{[2
]}

机构：

[1] 哈尔滨工业大学市政环境工程学院

[2] 哈尔滨师范大学生命与环境科学学院

来源：

环境科学 | 2006年 / 07期

基金：

国家杰出青年科学基金;

关键词：

DGGE; 16SrDNA; 活性污泥; 群落动态; 群落多样性;

D O I：

10.13227/j.hjkx.2006.07.033

中图分类号：

X172 [环境微生物学];

学科分类号：

摘要：

为探讨不同通用引物扩增16S rDNA靶序列对活性污泥微生物群落分析的影响,更合理的利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术分析活性污泥样品.从连续流搅拌槽式反应器(CSTR)中获取活性污泥,以3对通用引物341f/534r、968f/1 401r和341f/926r扩增16S rDNA序列,用DGGE分离PCR扩增产物.研究表明采用不同引物对进行DGGE分析时,群落多样性和动态存在显著的差异.341f/534r和968f/1 401r的靶序列分离效果较好,341f/926r的靶序列分离效果较差.引物341f/534r和341f/926r DGGE图谱显示S2和S3相似性高,引物968f/1 401r DGGE图谱显示S1和S2相似性高.由此可见采用不同引物对进行DGGE分析时,群落结构之间的相似性和动态是不一致的.341f/534r的DGGE图谱中条带丰富,多样性最好,968f/1 401r的DGGE图谱次之,341f/926r DGGE图谱条带最少,多样性也较差.因此,在利用DGGE分析活性污泥样品时采用引物341f/534r和968f/1 401r是比较适宜的.

引用

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