牡蛎和粪便中GⅠ、GⅡ型诺如病毒实时聚合酶链反应检测方法的建立

被引：2

作者：

孙亚萍 ^{[1
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程民 ^{[2
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宋士利 ^{[1
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张心会 ^{[1
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李蓉 ^{[2
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机构：

[1] 杭州市余杭区疾病预防控制中心检验科

[2] 中国疾病预防控制中心营养与食品安全所

来源：

中华流行病学杂志 | 2008年 / 06期

关键词：

实时聚合酶链反应; 诺如病毒; 基因型;

D O I：

暂无

中图分类号：

R155.5 [食品卫生与检验]; R450 [];

学科分类号：

摘要：

目的建立适用于牡蛎和粪便中快速、特异、灵敏的GⅠ、GⅡ型诺如病毒(NV)定量分型诊断方法。方法通过对GⅠ、GⅡ型NV基因组保守序列的比对分析,设计高度特异的引物和探针,建立以TaqMan探针为基础的实时聚合酶链反应方法(TaqMan Real-time RT-PCR)。结果该方法对NV核酸检测高度特异,且GⅠ和GⅡ型之间无交叉反应,最低检出限达10～2copies/μl。对90份新鲜牡蛎样品和37份腹泻粪便标本分别用常规RT-PCR和笔者建立的TaqMan Real-time RT-PCR进行NV检测,发现牡蛎样品中后者的检出率明显高于前者,而粪便标本中两者无明显差别。同时对阳性标本的测序分析证实结果准确可靠。结论研究中建立的TaqMan Real-time RT-PCR方法可用于海产品标本及粪便中NV定量及分型检测,可作为应对NV胃肠炎暴发的有效诊断方法。

引用