云南和山西无偿献血人群HCV部分基因的核苷酸序列测定及基因分型

被引：20

作者：

王敏 ^{[1
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周源 ^{[2
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陈帆 ^{[3
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王怡仲 ^{[4
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许茹 ^{[5
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夏文杰 ^{[5
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聂咏梅 ^{[5
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花文峰 ^{[5
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付涌水 ^{[5
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机构：

[1] 中山大学中山医学院生化教研室

[2] 太原市红十字血液中心

[3] 昆明血液中心

[4] 中山大学生命科学学院

[5] 广州血液中心

来源：

中国输血杂志 | 2009年 / 22卷 / 11期

基金：

广东省自然科学基金;

关键词：

丙型肝炎病毒(HCV); HCV基因型; 亚型; 基因测序; 基因分型; 无偿献血者; 云南; 山西;

D O I：

10.13303/j.cjbt.issn.1004-549x.2009.11.034

中图分类号：

R512.63 []; R450 [];

学科分类号：

摘要：

目的了解云南和山西2地无偿献血人群丙型肝炎病毒(HCV)的基因型分布及其差异。方法采用荧光定量PCR(Q-PCR),对所收集的203份ELISA检测抗-HCV阳性的无偿献血者标本(云南102份,山西101份)做核酸检测,对核酸阳性的标本做E1基因扩增和测序;E1基因阴性者,进一步做NS5B基因扩增;采用DNASTAR、Bi-oedit和Mega4等软件对E1、NS5B基因进行分析及分子进化研究。结果203份ELISA检测抗-HCV阳性的无偿献血者标本中,云南102份标本经Q-PCR检测出核酸阳性55份,从中扩增出E1基因43份,补做NS5B基因扩增获得阳性结果8份;山西省101份标本经Q-PCR检测出阳性46份,从中扩增出E1基因33份,补做NS5B基因扩增获得阳性结果6份。云南省献血者HCV基因型(亚型)可分为7种:1b[7.84%(4/51)]、2a[13.73%(7/51)]、3a[17.65%(9/51)]、3b[41.18%(21/51)]、6a[7.84%(4/51)]、6n[9.80%(5/51)]和6v[1.96%(1/51)];山西省献血者HCV基因型(亚型)较简单,可分为3种:1b[89.74%(35/39)]、2a[7.69%(3/39)]和3b[2.56%(1/39)]。结论我国云南和山西2地无偿献血人群中的HCV基因型(亚型)的分布存在明显的差异。

引用

页码：875 / 879

页数：5

共 3 条

[1]

云南省玉溪地区吸毒人群人类免疫缺陷病毒、丙型肝炎病毒、梅毒螺旋体感染状况及行为学调查 [J].