玉米不育系及其保持系线粒体atp6基因转录本编辑位点研究

被引:22
作者
汪静 [1 ]
曹墨菊 [1 ]
朱英国 [2 ]
潘光堂 [1 ]
荣廷昭 [1 ]
机构
[1] 四川农业大学玉米研究所/作物基因资源与遗传改良教育部重点实验室
[2] 武汉大学植物发育生物学教育部重点实验室
关键词
玉米; 细胞质雄性不育; 线粒体; RNA编辑; atp6;
D O I
10.16288/j.yczz.2007.06.014
中图分类号
S513 [玉米(玉蜀黍)]; Q943 [植物细胞遗传学];
学科分类号
071007 [遗传学]; 090104 [作物信息科学与技术];
摘要
以玉米同核异质细胞质雄性不育系T黄早四、C黄早四、S黄早四以及保持系N黄早四为材料,比较研究了供试材料小孢子发育到单核期的线粒体atp6基因转录本保守区域的编辑位点。结果表明,DNA序列在T、C、S3种胞质中完全一致,与N胞质相比除在27、28核苷酸处不同外,其余均一致,而各胞质cDNA序列却不尽相同。DNA和cDNA序列比较显示:atp6基因转录本保守区域内,N、S胞质中均存在19个编辑位点,T胞质存在22个,C胞质存在20个,它们相同的编辑位点有18个。大多数编辑位点都发生在密码子的第一、二位点上,可改变氨基酸的种类。18个相同的编辑位点大都为完全编辑,其中第1位点在各胞质中为部分编辑,第19位点除在N胞质中为完全编辑外其余胞质都为部分编辑。而各胞质特有编辑位点均以部分编辑的形式出现。由此可见,在玉米中atp6基因RNA编辑不仅具有序列特异性,同时还受到胞质背景的影响。通过分析还可看出,编辑的C残基前一个碱基多为嘧啶类碱基,编码氨基酸Ser和Pro的密码子较其他类的密码子更易受到编辑,且植物RNA的编辑有着改变蛋白质疏水性、增加物种间保守性的倾向。
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