求解蛋白质结构预测问题的二维连续模型及其相应的拟物算法

被引：27

作者：

黄文奇

黄勤波

石赫

机构：

[1] 华中科技大学计算机学院,华中科技大学计算机学院,中国科学院系统科学研究所武汉,武汉,北京

来源：

计算机研究与发展 | 2004年 / 11期

关键词：

蛋白质结构预测; NP难度问题; 折叠; 拟物算法; 引力势能;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q51 [蛋白质];

学科分类号：

070307 [化学生物学];

摘要：

研究了生物信息学中的一个重要问题 ,即蛋白质结构预测受物理世界的物体间相互作用的规律的启发 ,给出了该问题一个二维欧氏空间连续模型它比离散模型有一定的优越性 ,此模型的优点可能在于让计算很自然地利用到了一个客观存在的“天然导引” ,这个“天然导引”即是疏水氨基酸之间的引力 ,从而在构形优度相当的前提下 ,连续模型有助于计算速度的提高然后根据这个连续模型找到了相应的拟物算法 ,最后给出了一些实验结果 ,它们也说明了这个连续模型及相应的拟物算法的优点

引用

页码：1959 / 1965

页数：7

共 5 条

[1]

基于遗传算法的蛋白质折叠模拟系统 [J].