我国登革2型病毒04株包膜蛋白基因的核苷酸及其相应的氨基酸序列

被引:4
作者
杨佩英
SK Lam
机构
[1] 军事医学科学院徽生物学流行病学研究所
[2] 马来西亚大学医学微生物系
关键词
登革2型病毒04株; 包膜蛋白E基因; 核苷酸序列;
D O I
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学科分类号
摘要
本文报告我国登革2型04株包膜蛋白基因的核苷酸及氨基酸序列,并与登革1、3、4型及其它2型毒株如几内亚C株(NGC)、牙买加株1409(JAM)、候选疫苗株S1以及马来西亚当地流行株M1(登革出血热)、M2(登革休克综合征)。 M3(登革热)进行比较。结果表明D2-04株E蛋白基因的核苷酸序列与NGC,JAM和S1的同源性分别为95.0%、97.4%和90.0%;与M1、M2、M3的同源性分别为93.3%、92.1%和94.3%;与其它登革血清型的同源性大约为65%。登革2型04株蛋白的氨基酸序列与NGC、JAM、S1、M1、M2、M3的类似性分别为96.8%、97.2%、91.4%、95%、95.6%和94.3%。与其它登革血清型氨基酸类似性大约为62%~68%;与其它黄病毒的类似性范围为43%~47%。推断的氨基酸序列显示出7个保守的半胱氨酸残基及两个潜在的糖基化位点,分别位于Asn-67和Asn-153位。
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