家蚕核型多角体病毒bro基因的单核苷多态性研究

被引：4

作者：

王霞

潘国庆

庞敏

李艳红

周泽扬

机构：

[1] 西南农业大学农业部蚕桑学重点开放实验室

[2] 西南农业大学农业部蚕桑学重点开放实验室重庆

[3] 重庆

[4] 重庆师范大学生命科学学院

来源：

蚕业科学 | 2005年 / 03期

关键词：

家蚕核型多角体病毒; bro基因; 单核苷多态性; 插入/缺失; TajimaD检验;

D O I：

10.13441/j.cnki.cykx.2005.03.012

中图分类号：

S884.5 [病毒病（脓病）];

学科分类号：

0906 ;

摘要：

bro(baculovirus repeated ORFs)基因家族是一类存在于核型多角体病毒中比较复杂的基因家族。家蚕核型多角体病毒T3BmNPV基因组中有5个bro基因,分别为bro-a,bro-b,bro-c,bro-d,bro-e。对我国的BmNPVCQ1株进行了全基因组测序,与T3序列比较发现两个差异较大区域,分别命名为V1,V2区。在此基础上,对来自国内不同地区的另外5株BmNPV分离株对应的差异区域进行了研究,克隆了包含15个bro基因的10个DNA片段,其中包含了5个bro-c基因序列,5个bro-d基因序列,4个bro-e基因序列,加上公共数据库中已有的2个bro-c、2个bro-d、1个bro-e,合并后对bro-c、bro-d、bro-e分别进行核苷酸多态性分析,结果表明bro-c、d、e类基因都存在高密度的SNP位点。出现在这3类基因中的单核苷酸位点或核苷酸片段的插入/缺失数目分别为9、1、1。(θ,π)分析表明bro-c类基因的多态性在3类bro基因中最高。Tajima’D检验结果说明这些核苷酸变化符合中性突变假说。Pi(a)/Pi(s)分析暗示bro-c,bro-d和bro-e的N端的一些区段受到正向选择。

引用

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