对70个不同编号的新疆野生油菜和黑芥进行了染色体形态特征、过氧化物酶同工酶和mtDNA的研究,结果表明:新疆野生油菜的染色体数为2n=18,不同于黑芥(B.nigra)尤嫩斯2n=16。新疆野生油菜与黑芥的核型都为B型,但染色体比不同,新疆野生油菜的染色体比小于黑芥。用吉姆萨染色,新疆野生油菜带型不同于黑芥,最明显的差异是新疆野生油菜有一对染色体显全带,表示为组成型异染色质,而黑芥没有。过氧化物酶酶带的明显差异是新疆野生油菜比黑芥多一条酶带。mtDNA分析表明,新疆野生油菜与黑芥都有主带DNA分子,但新疆野生油菜还有两条质粒状DNA带,而黑芥没有。由此认为新疆野生油菜与黑芥不是同一个种,但亲缘关系密切,并推测在黑芥的演化过程中,新疆野生油菜可能是最原始的类型,到现在或许还有少数的过渡类型。