遗传密码和DNA序列的高维空间数字编码

被引：18

作者：

陈惟昌

陈志华

陈志义

王自强

邱红霞

机构：

[1] 中日友好临床医学研究所生物物理研究室!北京,中日友好临床医学研究所生物化学与分子生物学研究室!北京,中国科学院自动化研究所国家模式识别实验室!北京,中日友好临床医学研究所生物物理研究室!北京,中日友好临床医学研究所生物物理研究室!北京

来源：

生物物理学报 | 2000年 / 04期

关键词：

数字编码; DNA序列; 遗传密码; 高维空间; 汉明距离; 生物计算机;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q617 [生物结构理论];

学科分类号：

071011 ;

摘要：

二进制数字化编码是信息科学最基本的编码方式。用0(00)、1(01)、2(10)和3(11)4个数码对4种碱基(C、T、A、G)进行二进制数字编码 ,共有24种可能的编码组合 ,其中8种满足碱基互补法则 ,它们是拓扑等价的。按碱基分子量大小排列的编码格式 :0123/CTAG是最理想的编码格式。用二进制数对DNA的字符序列进行编码 ,有以下优点 :1)压缩信息冗余度 ,提高编码效率 ;2)可以对碱基的结构、功能基团、碱基互补、氢键强弱等性质进行编码 ;3)DNA序列的数字编码具有严格的大小顺序 ,即具有全序性质 ;4)DNA数字编码的对称性程度 ,与遗传密码简并度的对称性一致 ,并可得出氨基酸遗传密码的高维空间连通性简并法则 ;5)可以方便求出任意碱基重复单元的重复系列的数字编码法则 ;6)根据高维空间汉明编码距离的定义 ,可以确定任意多个DNA序列之间的信息距离和它们的交空间和并空间 ,对DNA序列生物信息学的分析研究有重要意义 ;7)DNA序列的数字编码可以方便进行各种数学运算和逻辑运算 ,对促进DNA生物计算机的发展 ,可有重大推动作用。

引用

页码：760 / 768

页数：9

共 11 条

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