基于PCR-DGGE指纹图谱川纹笛鲷及圆白鲳消化道壁优势菌群结构比较分析

被引：71

作者：

周志刚 ^{[1
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石鹏君 ^{[2
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姚斌 ^{[2
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何夙旭 ^{[2
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苏永全 ^{[3
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丁兆坤 ^{[2
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机构：

[1] 汕头大学海洋生物研究所

[2] 中国农业科学院饲料研究所

[3] 厦门大学海洋与环境学院

来源：

水生生物学报 | 2007年 / 05期

基金：

广东省自然科学基金; 中国博士后科学基金;

关键词：

川纹笛鲷; 圆白鲳; 16S rDNA; DGGE指纹图谱;

D O I：

暂无

中图分类号：

S917.4 [水产动物学];

学科分类号：

090805 [渔业资源学];

摘要：

本文采用免培养的16S rDNA梯度凝胶电泳技术(DGGE)对集约化海水网箱养殖川纹笛鲷Lutjanus sebae及圆白鲳Ephippus orbis消化道壁优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示川纹笛鲷及圆白鲳消化道壁存在着大量细菌群落,对DGGE指纹图谱聚类分析表明两种鱼肠道壁及胃壁菌群组成相似度高于50%,其中二者肠道壁细菌组成相似性最高(67%),这些可能与两种鱼养殖在同一水域、摄食相同饵料相关,另外通过软件对DGGE指纹带谱相对丰度分析表明同种鱼肠道壁及胃壁具有相同最大优势菌群。同时,两种鱼消化道壁之间在细菌多样性及相对丰度上亦存在明显区别,圆白鲳消化道壁细菌多样性要高于川纹笛鲷,这可能归因于川纹笛鲷与圆白鲳在天然环境中栖息地的差异性。本研究通过首次建立不同海水鱼消化道壁16S rDNA-DGGE指纹图谱及比较分析,为澄清海水鱼消化道壁微生物区系奠定基础。

引用

页码：682 / 688

页数：7

共 16 条

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