HIV-1整合酶与抑制剂LCA的结合模式及抗药性研究

被引：5

作者：

胡建平

常珊

陈慰祖

王存新

机构：

[1] 北京工业大学生命科学与生物工程学院

来源：

中国科学(B辑:化学) | 2007年 / 03期

基金：

北京市自然科学基金;

关键词：

分子对接; MD模拟; HIV-1 IN; 药物分子设计;

D O I：

暂无

中图分类号：

R91 [药物基础科学];

学科分类号：

100705 [微生物与生化药学];

摘要：

Ⅰ型人体免疫缺陷病毒(HIV-1)整合酶(integrase,IN)是病毒生命周期中一个重要的酶,也是研究抗HIV新药的一个重要靶点.运用多构象分子对接和分子动力学(molecular dynamics,MD)模拟,研究了野生型整合酶核心区及G140S点突变的突变态整合酶核心区与抑制剂L-菊苣酸(L-chicoric acid,LCA)的结合模式,并基于该结合模式探讨了G140S突变态整合酶对抑制剂LCA的抗药性.结果表明:LCA结合到G140S突变态整合酶核心区中的位置与结合到野生型整合酶核心区的位置不同,结合位置的差异导致LCA抑制作用的部分丧失;IN功能Loop区的柔性以及Mg2+离子与三个关键残基D64,D116和E152之间的相互作用有助于IN发挥生物学功能;G140S突变态整合酶核心区中的E152与LCA的排斥作用、K159与LCA结合能力的变弱以及Y143指向IN的口袋区是产生抗药性的重要原因.这些模拟结果与实验结果吻合,可为基于IN的抗HIV药物分子设计提供一些有用信息.

引用

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