广西药用野生稻遗传多样性分析及SSR引物数量对遗传多样性结果的影响研究

被引：17

作者：

苏龙 ^{[1
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徐志健 ^{[2
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乔卫华 ^{[2
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郑晓明 ^{[2
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梁云涛 ^{[3
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丁膺宾 ^{[1
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刘莎 ^{[2
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齐兰 ^{[2
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公婷婷 ^{[2
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梁新霞 ^{[2
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王君瑞 ^{[2
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张丽芳 ^{[2
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程云连 ^{[2
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兰进好 ^{[1
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杨庆文 ^{[2
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机构：

[1] 青岛农业大学农学院

[2] 中国农业科学院作物科学研究所

[3] 广西农业科学院水稻研究所

来源：

植物遗传资源学报 | 2017年 / 18卷 / 04期

基金：

国家重点研发计划;

关键词：

药用野生稻; 遗传多样性中心; 聚类分析; SSR引物数量;

D O I：

10.13430/j.cnki.jpgr.2017.04.001

中图分类号：

S511.9 [野生稻];

学科分类号：

090105 [作物生产系统与生态工程];

摘要：

采用25对SSR分子标记,对广西境内采集的1610份药用野生稻材料进行遗传多样性和聚类分析,其中检测到等位变异181个,有效等位基因数Ae范围为1.0094（RM240）2.2674（RM488）,平均值为1.3568;期望杂合度He范围为0.0093（RM240）0.5591（RM448）,平均值为0.2112;Shannon多样性指数I在0.0393～0.9296之间变动,平均值为0.3624。数据表明,广西药用野生稻遗传多样性较为丰富,12个药用野生稻地理居群按遗传多样性指数大小排序为:梧州-3>南宁-1>梧州-2>梧州-1>南宁-2>玉林-2>贵港-2>梧州-4>玉林-3>玉林-1>贺州>贵港-1,其中指数高的居群均分布于梧州市和南宁市两地,因此确定了这两地为广西药用野生稻的遗传多样性中心。通过不同数量的SSR引物对药用野生稻材料间相似系数矩阵进行相关性测验,结果显示当引物按照PIC值降序排列时,10对引物即达到较好聚类效果,升序排列时,21对引物即达到较好聚类效果。研究表明,在进行药用野生稻大居群聚类分析时,SSR引物适宜数量应多于21对,最低不得少于10对。

引用

页码：603 / 610

页数：8

共 16 条

[1]

标记引物数量对白桦遗传多样性的影响 [J].