基于伪F统计量的模糊聚类方法在基因表达数据分析中的应用

被引：8

作者：

易东

张彦琦

王文昌

张蔚

杨梦苏

黄明辉

方志俊

机构：

[1] 第三军医大学卫生统计学教研室

[2] 香港城市大学基因组科技应用研究中心

来源：

中国卫生统计 | 2002年 / 03期

关键词：

基因表达; 模糊聚类法; 伪F-统计;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q786 [基因的表达];

学科分类号：

071007 ; 0836 ; 090102 ;

摘要：

目的　通过对基因芯片数据的分析 ,提出一种基因表达的分类方法。方法　首先 ,应用FCM模糊聚类法(FuzzyClusteringMethod)进行聚类 ,然后我们应用PFS(PseudoF statistics)统计量作为一个判别函数来确定最佳类数目。结果　将本方法应用于模拟数据、人类纤维原细胞血清基因表达数据上 ,其结果明显好于K 均值法。结论　本方法基于没有聚类数据的任何先验知识和组成成分信息的前提下 ,考虑如何确定数据的分类结构。根据实际结果发现 ,该方法是揭示基因表达变化内在模式的有力工具

引用

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