采用15对多态性较好的AFLP引物对52份崖城系列甘蔗亲本品系的遗传多样性进行分析,结果表明,每对引物的多态性位点平均为61.40,多态性位点率为77.30%。52份材料的遗传相似系数在0.4832-0.9614之间,平均为0.6806,遗传多样性属中等水平。来自同一组"合CP72-1210×崖城82-108"品系的遗传相似性系数很高,在0.7836-0.8398范围内,平均是0.8117。以遗传相似系数阈值约为0.6700划分,聚类分析把52份材料分为5大类,系谱记录中亲缘关系密切的品系,大多数都能归为同一类。不同年代品系的遗传多样性指数差异明显,最高是20世纪90年代,为0.3155,最低是20世纪的50-70年代,为0.2654;来自相一组合的后代品系遗传多样性指数较低。建议在亲本创新过程中,同一亲本不宜过多重复使用。