微卫星分子标记在木薯种质资源遗传分析中的应用

被引：24

作者：

邹积鑫

李开绵

王文泉

机构：

[1] 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

[2] 中国热带农业科学院热带生物技术研究所热带作物生物技术国家重点实验室海南儋州

[3] 海南儋州

[4] 海口

来源：

华南热带农业大学学报 | 2005年 / 02期

关键词：

木薯; 微卫星标记; 遗传多样性; 聚类分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

S533 [木薯（树薯）];

学科分类号：

摘要：

采用28对微卫星标记(SSR)对我国现存89个木薯品种进行遗传多样性分析,共获得93个基因位点,其中多态性位点88个,平均多态性水平为94.6%。运用Gensury软件统计了总群体的遗传杂合度(Ht)、群体内的平均基因多样性(Hs)、群体间的基因漂变频率(Dst)和遗传分化系数(Gst=Dst/Ht),结果表明,群体的基因杂合度居中,群体内部遗传多样性较小,存在一定程度的基因漂流;进一步用NTSYS-pc计算品系间的遗传相似系数,获得UPGMA聚类图,表明品系间遗传相似系数变化范围为0.430￣0.952,以平均遗传相似系数0.58为阈值,所有品系分为4类(A,B,C和D组)。其中A组最大,有72个品系,包括3个亚组:A1为国内收集的农家品系,A2品系均来自哥伦比亚,A3为一个独立品系。说明木薯引入中国已经发生了一些遗传分化。进一步分析表明,分组后每组内部的遗传多样性指数在0.20￣0.30之间,其组内的遗传多样性贫乏。

引用

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共 3 条

[1] RAPD-based genetic diversity study of fifty cassava (Manihot esculenta Crantz) genotypes [J].

Asante, IK ;

Offei, SK .

EUPHYTICA, 2003, 131 (01) :113-119

[2]

Using microsatellites, isozymes and AFLPs to evaluate genetic diversity and redundancy in the cassava core collection and to assess the usefulness of DNA-based markers to maintain germplasm collections[J] . Paul Chavarriaga-Aguirre,María M. Maya,Joe Tohme,Myriam C. Duque,Carlos Iglesias,Merideth W. Bonierbale,Steve Kresovich,Gary Kochert.Molecular Breeding . 1999 (3)

[3]

Microsatellites in Cassava (Manihot esculenta Crantz): discovery, inheritance and variability[J] . P. P. Chavarriaga-Aguirre,M. M. Maya,M. W. Bonierbale,S. Kresovich,M. A. Fregene,J. Tohme,G. Kochert.TAG Theoretical and Applied Genetics . 1998 (3)

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