皂甙的三维定量构效关系研究

被引:7
作者
谷妍
陈敏伯
董喜城
陈海峰
曾宝珊
冯传莉
俞飙
惠永正
机构
[1] 中国科学院上海有机化学研究所计算机化学开放实验室
[2] 中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室
关键词
三维定量构效关系(3D-QSAR); 比较分子场分析(CoMFA); 皂甙;
D O I
暂无
中图分类号
O629 [天然化合物];
学科分类号
摘要
针对目标分子柔性大的特点,在比较分子场分析(CoMFA)方法中采用交叉验证相关系数平方R2引导的构象选择法.对12个皂甙分子的生物活性进行了三维定量构效关系研究.探讨了几种探针对构效关系结果的影响,并选择了一种较合理的“复合”探针方案.应用该复合探针构建CoMFA模型,发现影响药效的立体场与静电场的贡献分别为40%和4O%,其它能量项的贡献为20%.该模型交叉验证的相关系数平方R2为0.653,非交叉验证的R2为0.991,方差比F(4,7)值130.195(即置信度99%以上),活性预计的标准偏差与极差比(s/Δγ)为4.2%,表明模型具有较好的预测能力.根据该模型,预计在指定位置添加位阻较大的基团活性值提高将会比较明显.
引用
收藏
页码:1534 / 1539
页数:6
相关论文
共 5 条
[1]  
M.-Z.Liu,C.Li,B.Yu,M-B Chen,C.-L.Feng,Y.-Z.Hui,Chin. Chemistry Letters . 1997
[2]  
M.Yoshikawa,E.Harada,H.Matsuda,T.Murakami,J.Yamahara,N.Murakami,Chem. Pharmaceutical Bulletin . 1993
[3]  
M.Clark,R.D.CramerⅢ,N.van Opdenbosch,J.Comput. Chemtracts . 1989
[4]  
R.D.CramerⅢ,D.E.Patterson,J.D.Bunce,J.Am. Chemical Society Reviews . 1988
[5]  
M.Nishizawa,H.Yamada,Y.Yamguchi,S.Halakeyam,I.-S.Lee,J.Kim,A.D.Kinghorn,Chem. Lett . 1994