与苹果Co基因紧密连锁的RAPD标记的筛选及其SCAR标记转换(英文)

以短枝富士 (SpurFuji)×舞姿 (Telamon)的 10 5株F1群体为试材 ,利用RAPD技术 ,结合集群分类分析法(BSA)进行了苹果柱型基因 (Co)分子标记的研究。通过对 30 0条随机引物的筛选 ,获得一个与Co基因紧密连锁的RAPD标记S114 2 682 ,连锁距离为 2 .86cM。对该标记片段进行序列测定 ,然后根据序列特点设计了 4条特异引物(其中正向引物与反向引物各两条 )。PCR结果显示 ,这 4条引物的 4种组合都可以扩增出柱型性状的特征带。选其中之一进行群体上的分析 ,结果表明该SCAR标记特征带与柱型性状的共分离行为与原RAPD标记表现一致。可见 ,此组合的引物可以作为该SCAR标记的特异引物。通过对S114 2 682 标记片段序列分析发现 ,在 +45～ +2 5 1区域含有一个可编码 6 8个氨基酸残基的ORF。