肾综合征出血热病毒Gou3株M片段的分子特性及序列的比较分析

为测定我国肾综合征出血热病毒 Ｇｏｕ３ 株的 Ｍ 片段全基因序列，了解该株分子基础，并分析其与其他病毒株的差异，将提取的感染了病毒的 Ｖｅｒｏ － Ｅ６ 细胞总 Ｒ Ｎ Ａ 进行逆转录 Ｐ Ｃ Ｒ扩增，产物直接或纯化后克隆于 Ｔ 载体并测定序列，结果测得 Ｇｏｕ３ 株 Ｍ 片段的全基因序列共３ ６５１ 个核苷酸，最大读码框架从４７ 到３ ４４８ ，共编码１ １３４ 个氨基酸。四种核苷酸的比例分别为 Ａ３０６９ ％ ， Ｔ ３００１ ％ ， Ｇ２１５５ ％ ， Ｃ１７７５ ％ ， Ｇ Ｃ 含量为３９３０ ％ ， Ａ Ｔ 含量为６０７０ ％ 。应用不同的载体系统、不同的转化用菌种、从不同的传代株中扩增，确证了测序结果的正确性。序列同源比较分析表明： Ｇｏｕ３ 株与 Ｈ Ｔ Ｎ 型同源性为７０５ ％ ～７１５ ％ ，与 Ｓ Ｅ Ｏ 型为８３９ ％ ～８４５ ％ ；其氨基酸序列与 Ｈ Ｔ Ｎ 型同源性为７６５ ％ ～７７３ ％ ，与 Ｓ Ｅ Ｏ 型为９３２ ％ ～９７３ ％ 。核苷酸序列及其系统发生树分析表明： Ｓ Ｅ Ｏ 型的毒株间 Ｍ 片段全基因序列同源性较高为９４７ ％ ～９９５ ％ ，而 Ｇｏｕ３ 株与 Ｓ Ｅ Ｏ 型毒株间差异高达１５４ ％ ～１６１ ％ ， Ｇ２ 区域３３