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云南景洪直立型普通野生稻抗稻瘟病Pi-ta+等位基因的克隆与分析
被引:21
作者
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耿显胜
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杨明挚
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云南大学生命科学学院
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杨明挚
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黄兴奇
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程在全
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付坚
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孙涛
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云南省西双版纳州农业科学研究所
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孙涛
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李俊
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云南省西双版纳州农业科学研究所
云南大学生命科学学院
李俊
[
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机构
:
[1]
云南大学生命科学学院
[2]
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
[3]
云南省西双版纳州农业科学研究所
来源
:
遗传
|
2008年
/ 01期
关键词
:
景洪直立型普通野生稻;
Pi-ta+等位基因;
基因克隆;
DNA多态性;
D O I
:
暂无
中图分类号
:
S511.9 [野生稻];
学科分类号
:
090105
[作物生产系统与生态工程]
;
摘要
:
用PCR法从景洪直立紫杆普通野生稻中克隆了抗稻瘟病基因Pi-ta+的4672bp序列,该序列包含完整的编码框、内含子和终止密码子下游的331bp。所克隆的直立型紫杆普通野生稻Pi-ta基因序列的编码区与已报道的日本栽培稻社糯(Yashiro-mochi)和元江普通野生稻相应序列间的同源性分别为99.86%和98.78%。与社糯的Pi-ta基因相比,其编码区有4个核苷酸的差异并导致3个氨基酸残基的改变,而内含子区域有6个核苷酸差异。对该序列进一步分析发现,其推导的氨基酸残基的918位为丙氨酸,属于稀有的抗稻瘟病的Pi-ta+等位基因。景洪直立型普通野生稻Pi-ta+基因因其编码序列和推导的氨基酸序列与社糯有所不同,推测其抗病能力大小和抗菌谱可能与社糯的Pi-ta基因不同。直立型普通野生稻中Pi-ta+等位基因的克隆为进一步利用该基因改良栽培稻抗病能力提供了前期物质基础。
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[1]
云南元江普通野生稻中Pi-ta和Pib同源基因的克隆和分析
[J].
杨明挚
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云南大学生命科学学院
云南大学生命科学学院
杨明挚
;
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程在全
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陈善娜
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钱君
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尹梅
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吴成军
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云南省农业科学院生物技术研究所
云南大学生命科学学院
吴成军
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机构:
黄兴奇
.
植物生理学通讯,
2007,
(03)
:483
-486
[2]
非AA型野生稻资源在水稻育种中的利用
[J].
张武汉
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湖南农业大学
湖南农业大学
张武汉
;
何强
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国家杂交水稻工程技术研究中心
湖南农业大学
何强
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机构:
舒服
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机构:
邓华凤
.
杂交水稻,
2006,
(05)
:1
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[3]
假基因的组成、分布及其分子进化
[J].
黄志华
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机构:
浙江大学农业与生物技术学院
黄志华
;
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机构:
薛庆中
.
植物学通报,
2006,
(04)
:402
-408
[4]
2002年黑龙江省部分稻区稻瘟病菌生理小种鉴定
[J].
论文数:
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机构:
张亚玲
;
论文数:
引用数:
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机构:
靳学慧
.
植物保护,
2006,
(02)
:31
-34
[5]
水稻抗稻瘟病基因Pi-ta共显性分子标记的建立
[J].
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王忠华
;
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USDA-ARS Dale Bumpers National Rice Research Center, Stuttgart, AR , USA
浙江万里学院生物技术研究所
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贾育林
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USDA-ARS Dale Bumpers National Rice Research Center, Stuttgart, AR , USA
浙江万里学院生物技术研究所
贾育林
.
中国水稻科学,
2005,
(06)
:483
-488
[6]
云南野生稻中Xa21基因外显子Ⅱ的分离及序列分析
[J].
钱君
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云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南大学生命科学学院,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室昆明,昆明,昆明,昆明,昆明,昆明
钱君
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程在全
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云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南大学生命科学学院,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室昆明,昆明,昆明,昆明,昆明,昆明
程在全
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杨明挚
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云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南大学生命科学学院,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室昆明,昆明,昆明,昆明,昆明,昆明
杨明挚
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刘继梅
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云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南大学生命科学学院,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室昆明,昆明,昆明,昆明,昆明,昆明
刘继梅
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吴成军
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云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南大学生命科学学院,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室昆明,昆明,昆明,昆明,昆明,昆明
吴成军
;
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机构:
黄兴奇
.
遗传,
2005,
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:382
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[7]
水稻抗稻瘟病基因Pi-ta的分子标记辅助选择
[J].
王忠华
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浙江万里学院生物技术研究所,USDA-ARSDaleBumpersNationalRiceResearchCenter,Stuttgart,Arkansas,浙江大学原子核农业科学研究所,浙江大学原子核农业科学研究所浙江宁波USDA-ARSDaleBumpersNationalRiceResearchCenter,Stuttgart,Arkansas,USA浙江大学原子核农业科学研究所,浙江杭州,USA,浙江杭州,浙江杭州
王忠华
;
贾育林
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贾育林
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吴殿星
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吴殿星
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夏英武
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夏英武
.
作物学报,
2004,
(12)
:1259
-1265
[8]
云南野生稻对稻瘟病的抗性评价
[J].
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梁斌
;
肖放华
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云南省农业科学院农作物品种资源站!云南昆明,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,云南省农业科学院农作物品种资源站!云南昆明,,云南省农业科学院
肖放华
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黄费元
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云南省农业科学院农作物品种资源站!云南昆明,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,云南省农业科学院农作物品种资源站!云南昆明,,云南省农业科学院
黄费元
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彭绍裘
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彭绍裘
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陈勇
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陈勇
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戴陆国
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云南省农业科学院农作物品种资源站!云南昆明,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,云南省农业科学院农作物品种资源站!云南昆明,,云南省农业科学院
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刘二明
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云南省农业科学院农作物品种资源站!云南昆明,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,云南省农业科学院农作物品种资源站!云南昆明,,云南省农业科学院
刘二明
.
中国水稻科学,
1999,
(03)
[9]
云南省疣粒野生稻、药用野生稻和普通野生稻多抗性鉴定
[J].
彭绍裘
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彭绍裘
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魏子生
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黄河清
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肖放华
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罗宽
.
植物病理学报,
1982,
(04)
[10]
抗稻瘟病新基因pi-hit-1的克隆与功能研究.[J].李常银;杨谦;王晓飞;孙野青;.高技术通讯.2004, 10
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[1]
云南元江普通野生稻中Pi-ta和Pib同源基因的克隆和分析
[J].
杨明挚
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杨明挚
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吴成军
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黄兴奇
.
植物生理学通讯,
2007,
(03)
:483
-486
[2]
非AA型野生稻资源在水稻育种中的利用
[J].
张武汉
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湖南农业大学
湖南农业大学
张武汉
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何强
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邓华凤
.
杂交水稻,
2006,
(05)
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[3]
假基因的组成、分布及其分子进化
[J].
黄志华
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浙江大学农业与生物技术学院
黄志华
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薛庆中
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植物学通报,
2006,
(04)
:402
-408
[4]
2002年黑龙江省部分稻区稻瘟病菌生理小种鉴定
[J].
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张亚玲
;
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机构:
靳学慧
.
植物保护,
2006,
(02)
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-34
[5]
水稻抗稻瘟病基因Pi-ta共显性分子标记的建立
[J].
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王忠华
;
Redus MARC
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贾育林
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贾育林
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中国水稻科学,
2005,
(06)
:483
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[6]
云南野生稻中Xa21基因外显子Ⅱ的分离及序列分析
[J].
钱君
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云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南大学生命科学学院,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室,云南省农业科学院生物技术重点实验室昆明,昆明,昆明,昆明,昆明,昆明
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刘继梅
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吴成军
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机构:
黄兴奇
.
遗传,
2005,
(03)
:382
-386
[7]
水稻抗稻瘟病基因Pi-ta的分子标记辅助选择
[J].
王忠华
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王忠华
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贾育林
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吴殿星
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夏英武
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夏英武
.
作物学报,
2004,
(12)
:1259
-1265
[8]
云南野生稻对稻瘟病的抗性评价
[J].
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梁斌
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肖放华
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肖放华
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黄费元
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彭绍裘
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彭绍裘
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陈勇
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戴陆国
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刘二明
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云南省农业科学院农作物品种资源站!云南昆明,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,湖南省农业科学院植物保护研究所!湖南长沙,,云南省农业科学院农作物品种资源站!云南昆明,,云南省农业科学院
刘二明
.
中国水稻科学,
1999,
(03)
[9]
云南省疣粒野生稻、药用野生稻和普通野生稻多抗性鉴定
[J].
彭绍裘
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机构:
湖南农业科学院,湖南农业科学院,湖南农业科学院,湖南农业科学院,湖南农业科学院,湖南农学院
毛昌祥
;
黄河清
论文数:
0
引用数:
0
h-index:
0
机构:
湖南农业科学院,湖南农业科学院,湖南农业科学院,湖南农业科学院,湖南农业科学院,湖南农学院
黄河清
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肖放华
论文数:
0
引用数:
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h-index:
0
机构:
湖南农业科学院,湖南农业科学院,湖南农业科学院,湖南农业科学院,湖南农业科学院,湖南农学院
肖放华
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论文数:
引用数:
h-index:
机构:
罗宽
.
植物病理学报,
1982,
(04)
[10]
抗稻瘟病新基因pi-hit-1的克隆与功能研究.[J].李常银;杨谦;王晓飞;孙野青;.高技术通讯.2004, 10
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