水稻腈水解酶家族的生物信息学分析

被引:5
作者
王爱荣 [1 ,2 ]
刘向国 [3 ]
赵旭 [2 ]
鲁国东 [2 ]
机构
[1] 福建农林大学计算机与信息学院
[2] 福建农林大学生物农药重点实验室
[3] 福州市园林科学研究院
关键词
水稻; 腈水解酶; 基因家族; 系统发育分析; 结构和功能;
D O I
暂无
中图分类号
S511 [稻];
学科分类号
0901 ;
摘要
为了更好地了解水稻腈水解酶家族的功能,采用生物信息学的方法对水稻中的腈水解酶进行了一系列分析,结果发现水稻中共有8个编码腈水解酶的基因,虽然基因结构很不相同,但其所编码的腈水解酶都具有典型的碳氮水解酶结构域和保守的Glu-Lys-Cys催化三联体。通过EST搜索发现这些基因在水稻不同组织和不同胁迫条件下的表达情况存在较大的差异。此外,对水稻和拟南芥腈水解酶进行系统进化分析发现其分别处于5个不同的分支,表明它们的分化早于单子叶植物和双子叶植物的分化。研究结果为进一步研究该类蛋白的分子和生物学功能奠定了良好基础。
引用
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