西南糯玉米地方品种waxy基因序列多态性分析

被引:31
作者
田孟良 [1 ]
黄玉碧 [1 ]
谭功燮 [2 ]
刘永建 [1 ]
荣廷昭 [2 ]
机构
[1] 四川农业大学农学院
[2] 四川农业大学玉米研究所
关键词
糯玉米; waxy基因; 核苷酸多态性; 地方品种;
D O I
暂无
中图分类号
S513 [玉米(玉蜀黍)];
学科分类号
0901 ;
摘要
为了解我国西南地区糯玉米和硬粒玉米waxy基因核苷酸多态性,对23份中国西南玉米地方品种(16份糯玉米和7份硬粒玉米)、2份美洲糯玉米种质的waxy基因第9外显子至第14外显子之间核苷酸序列进行测定,将所得序列与GenBank中的16份同源序列(来自小颖大刍草、繁茂大刍草和美洲地方栽培品种)进行序列比对。结果表明,西南糯玉米、西南硬粒玉米和小颖大刍草分别具有14、19和40个多态性位点,西南糯玉米waxy位点核苷酸多态性为西南硬粒玉米的30%,是小颖大刍草的14%,Tajima’D检验仅在糯玉米群体D值显著,HKA检验表明waxy位点未受选择作用;序列比对发现12份西南糯玉米第10外显子同一位置缺失15个核苷酸,该位点恰为糖基转移酶结构域的起始位置。可见我国糯玉米通过较为独特的突变机制而形成,在进化过程中经历了驯化瓶颈,奠基者效应使西南糯玉米waxy位点核苷酸多态性大大降低,从近缘物种中引入等位变异是改良玉米淀粉质量和产量的关键。
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[8]   MOLECULAR ANALYSIS OF THE WAXY LOCUS OF ZEA-MAYS [J].
KLOSGEN, RB ;
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SAEDLER, H .
MOLECULAR AND GENERAL GENETICS, 1986, 203 (02) :237-244
[9]  
Alternative splicing induced by insertion of retrotransposons into the maize waxy gene. Varagona M J,Purugganan M,Wessler S R. The Plant Cell . 1992
[10]  
Genetic diversity and selection in the maize starch pathway. Whitt SR, Wilson LM, Tenaillon MI, Gaut BS, Buckler ES. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 2002