黄瓜花叶病毒西番莲分离物RNA3的cDNA全长克隆和序列分析

被引：8

作者：

王海河

谢联辉

林奇英

机构：

[1] 福建农林大学植物病毒研究所!福建福州

来源：

福建农业大学学报 | 2001年 / 02期

关键词：

黄瓜花叶病毒西番莲分离物; RNA3; 全长cDNA克隆; 序列分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

S432 [植物病害及其防治];

学科分类号：

090401 ;

摘要：

采用 RT- PCR方法克隆了黄瓜花叶病毒西番莲致死分离物 ( CMV- PE)全长 RNA3.经核苷酸序列测定 ,明确 PE分离物 RNA3全长 2 2 16nt,含有 2个开放阅读框 ( ORF) ,其中 5'端的 ORF( 12 1- 963nt)编码2 79aa的 3a蛋白 ,3'端 ORF( 12 60 - 1916nt)编码 2 18aa的 CP蛋白 .5'端非编码区 ( NR)长 12 0 nt,基因间隔区 ( IR)长 2 96nt,3'端 NR区含 30 1个碱基 .PE分离物编码的 3a蛋白中最明显的特征是在 136- 141位有一个独特的 VWCL SS区域 .将 CMV- PE的 RNA3的核苷酸序列及其编码蛋白的氨基酸序列与同属 CMV亚组 I的其它分离物进行比较 ,发现症状相似的 CMV分离物的非编码区具有很高的序列同源性 ,说明非编码区序列与症状有关

引用

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