目的:建立黄芩的毛细管电泳指纹图谱(CEFP)并测定黄芩苷含量。方法:以50 mmol/L硼砂溶液(含5%乙腈,pH9.30)为背景电解质,石英毛细管(75 cm×75μm i.d.),有效长度63 cm,运行电压12 kV,紫外检测波长280 nm,重力进样15 s(高度10 cm)。用定性相似度SF、含量相似度Q、宏观含量相似度R等指数评价黄芩CEFP,以CZE测定黄芩苷含量。结果:以萘普生峰为参照物峰,确定了8个共有峰,10个产地黄芩的CEFP与黄芩苷的CEFP具有良好相似性。含量测定结果表明不同产地黄芩中黄芩苷含量有明显差异。结论:所建立的CEFP及含量分析方法均具有较好的重现性,两者结合为黄芩药材质量控制提供了新方法。