3种蛏类线粒体16SrRNA和COI基因片段的序列比较及其系统学初步研究

被引:33
作者
陈丽梅
孔晓瑜
喻子牛
于珊珊
徐晖
机构
[1] 中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室
关键词
竹蛏科; 线粒体; 16SrRNA基因; COI基因;
D O I
暂无
中图分类号
S917.4 [水产动物学];
学科分类号
摘要
对3种蛏类大竹蛏(Solengrandis),长竹蛏(Solenstrictus)和小刀蛏(Cultellusattenuatus)的线粒体16SrRNA和COI基因片段序列进行了比较并对其系统学进行了初步研究。得到的序列总长度分别为472~481bp(16S)和658bp(COI)。3种蛏序列的碱基组成均显示出较高的A+T比例(16SrRNA基因62.1%;COI基因62.8%)。对位排序比较表明,16SrRNA片段种内个体间变异较小,3种类间存在128个碱基变异位点(其中包括127个简约信息位点)和5个插入/缺失位点,总共12个碱基长;COI片段有200个碱基存在变异,其中包括191个简约信息位点,不存在任何插入/缺失位点。数据分析结果表明16SrRNA和COI基因片段大竹蛏与长竹蛏两片段的遗传距离分别为0.0856和0.1712,两竹蛏类与小刀蛏的遗传距离分别为0.3054,0.2798和0.2662,0.2933。作者认为小刀蛏与竹蛏之间的遗传距离已达到科之间的水平,结果支持将其提升为刀蛏科的分类观点。3种蛏类线粒体16SrRNA和COI基因在种间明显的多态性,证实了16SrRNA和COI基因序列均普遍适用于蛏类种及以上阶元的系统学分析。
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