用随机扩增多态性方法对四川、湖南、湖北交界处的27个水杉样本进行了基因组DNA多态性分析.11个随机引物共获得RAPD谱带121条,多态性谱带占53%.聚类分析结果表明:水杉个体间的遗传距离与这些个体的地理分布相关,即相同产地个体间的遗传距离较小,不同产地个体间的遗传距离较大.与松柏目其它类群相比,水杉居群的遗传多样性程度高于银杉(32%),而在所处的大类群中则处于中等水平.初步结果表明,尽管孑遗物种水杉的自然种群的目前分布范围和个体数目非常有限,但是它仍然保持着中度的遗传多样性水平.可推测,孑遗植物的遗传多样性水平具有一定的变异范围