蜡样芽孢杆菌ERIC-PCR分子分型方法的建立

被引:8
作者
王君 [1 ,2 ]
吴清平 [2 ]
吴克刚 [1 ]
陈谋通 [2 ]
张菊梅 [2 ]
郭伟鹏 [2 ]
机构
[1] 广东工业大学轻工化工学院
[2] 广东省微生物研究所 广东省华南应用微生物重点实验室-省部共建国家重点实验室 广东省菌种保藏与应用重点实验室 广东省微生物应用新技术公共实验室
关键词
蜡样芽孢杆菌; ERIC-PCR; 分子分型; 遗传多样性分析;
D O I
10.13982/j.mfst.1673-9078.2013.07.059
中图分类号
TS207.4 [食品的微生物检验];
学科分类号
083201 ;
摘要
为建立简单快速的蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus)基因间重复共有序列PCR(ERIC-PCR)的分子分型方法,该研究以B.cereusCMCC 63303的基因组DNA为模板,并采用正交设计L16(45)对影响ERIC-PCR反应体系的五个因素(模板DNA、Mg2+、dNTP、TaqDNA聚合酶、引物)在四个浓度水平上进行优化,并通过单因素试验确定最佳退火温度,最后以优化后的反应体系对50株B.cereus分离株进行ERIC-PCR分子分型和聚类分析验证其稳定性和分型效果。结果显示应用建立的ERIC-PCR反应体系对50株分离株扩增均得到了9-17条、大小在200-4000 bp之间的条带,并可将其分为47个型,且分辨力达到0.996,具有较高稳定性和分辨能力。表明ERIC-PCR技术对B.cereus分型,具有简便和分辨力高等优点,可用于食源性B.cereus分离株的多样性研究。
引用
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页码:1696 / 1701
页数:6
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