胃癌转导信号调控网络在胃癌发生发展中的相关性研究

被引:3
作者
唐明武
陈文习
机构
[1] 湖北省鄂州中心医院消化内科
关键词
胃癌; 转录因子; 转录调控网络;
D O I
暂无
中图分类号
R735.2 [胃肿瘤];
学科分类号
100112 [医学生物化学与分子生物学];
摘要
目的筛选胃癌发生发展过程中的差异表达基因,构建差异调控网络。方法在本文的研究中,我们从公共基因表达数据库(GEO数据库)中下载胃癌相关表达谱数据GSE2685的基因芯片(7个正常组织样本,23个胃癌组织样本),筛选胃癌和正常胃组织的差异基因(P<0.05及差异值>2或<-2);计算差异基因与靶基因间的皮尔森相关系数(∣PCC∣>0.75),构建差异调控网络;GO富集方法分析差异调控网络基因的功能。结果在这个调控网络中,一些转录因子(TFs)和靶基因在之前的相关研究中已经被证实与胃癌相关。此外我们也发现一些新的转录因子和靶基因与胃癌相关。有效的整合以往的研究结果,让我们对应用转录调控网络识别胃癌相关基因的方法有了新的认识。结论基于转录调控网络的方法识别胃癌相关基因具有很好的应用价值。
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[1]
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[2]
Prognostic Role of Estrogen Receptor α and Estrogen Receptor β in Gastric Cancer.[J].C. Y. Xu;J. L. Guo;Z. N. Jiang;S. D. Xie;J. G. Shen;J. Y. Shen;L. B. Wang.Annals of Surgical Oncology.2010, 9
[3]
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Guo, Xiaobo ;
Guo, Lei ;
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Yu, Yingyan .
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 2010, 398 (01) :1-6