利用基因表达系列分析数据库进行数字化基因差异显示筛选胃癌相关基因

被引：2

作者：

熊芳 ^{[1
]}

肖大光 ^{[1
]}

曾朝阳 ^{[2
]}

熊炜 ^{[3
]}

阳菊华 ^{[3
]}

机构：

[1] 中南大学信息科学与工程学院

[2] 中南大学肿瘤研究所

[3] 中南大学福建医科大学分子医学研究中心

来源：

中国医师杂志 | 2006年 / 03期

关键词：

胃肿瘤; 基因组; 基因组学; 自动数据处理;

D O I：

暂无

中图分类号：

R735.2 [胃肿瘤];

学科分类号：

100214 ;

摘要：

目的对肿瘤基因组解剖计划获得的海量数据进行充分数据挖掘,筛选胃癌差异表达基因。方法采用数字化基因差异显示技术对肿瘤基因组解剖计划数据库中的4个胃癌和2个正常胃组织文库共300,783条基因表达系列分析数据进行了分析。结果筛选出差异表达的已知基因136个,其中胃癌中表达上调的有54个,下调82个,EST序列65条,其中上调24条,下调41,虚拟Northern和数字化显示对筛选出的差异表达基因PTMA构建了全身正常组织和肿瘤组织的基因表达图谱。结论充分利用生物信息学工具可以快速有效地筛选肿瘤差异表达基因,指导后续分子生物学实验研究。筛选出来的差异表达基因通过验证,有望成为新的胃癌分子靶标。

引用

页码：302 / 305

页数：4

共 3 条

[1] 利用动态等位基因特异性杂交技术进行单核苷酸多态高通量分型 [J].

曾朝阳 ;

熊炜 ;

沈守荣 ;

朱诗国 ;

李小玲 ;

李伟芳 ;

李江 ;

周鸣 ;

范松青 ;

马健 ;

周洁 ;

肖炳燚 ;

贺林 ;

李桂源 .

生物化学与生物物理进展, 2002, (05) :806-810

[2] 表达序列标签数据库搜索鉴定小鼠UBAP1基因及其数字化表达分析 [J].

钱骏 ;

董利 ;

张必成 ;

王洁如 ;

周鸣 ;

李忠花 ;

李伟芳 ;

李小玲 ;

李桂源 .

生物化学与生物物理进展, 2002, (02) :323-327

[3]

High Throughput Analysis of Gene Expression in the Human Brain..Colantuoni C; Purcell AE; Bouton CM; et al;.J Neurosci Res.2000,

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