河豚白介素2基因鉴定及其生物信息学分析

被引：4

作者：

董伟仁

邵健忠

项黎新

机构：

[1] 浙江大学生命科学学院

来源：

浙江大学学报(理学版) | 2006年 / 06期

基金：

浙江省自然科学基金;

关键词：

河豚; IL-2基因; 鉴定; 比较基因组学;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q953 [动物遗传学];

学科分类号：

071007 ; 090501 ;

摘要：

利用比较基因组学方法,在河豚（Fugu rubripes）基因组中鉴定了IL-2基因（FrIL-2）.该基因为单拷贝基因,其结构、染色体定位均和人等高等动物一致,但基因非常精简.基因上游调控区含众多转录因子结合位点,3 UTR含poly（A）加尾信号和8个细胞因子类普遍存在的转录不稳定序列;FrIL-2基因编码149个氨基酸,N端含22个氨基酸组成的信号肽,肽链内含8个Cys,其中和生物学活性相关的Cys-66和Cys-116高度保守,在结构上存在一个类似IL-2特征性功能域结构,此外还存在一些修饰位点如N-糖基化位点和N端酰基化位点.比较河豚与人、哺乳动物、鸟类等IL-2的同源性,其氨基酸序列相似性为25%34%.研究结果为今后利用鱼类基因组数据库和生物信息学快速鉴定新的鱼类功能基因打下了方法学基础,也为进一步开展鱼类IL-2基因功能研究提供了科学依据.

引用

页码：688 / 694+701 +701

页数：8

共 9 条

[1] 鱼类的干扰素系统和干扰素系统基因的鉴定 [J].

张义兵 ;

张奇亚 ;

桂建芳 .

水生生物学报, 2004, (03) :317-322

[2] 虹鳟肿瘤坏死因子(TNFα)基因体外表达与纯化的研究 [J].

蔡中华 ;

宋林生 ;

C J SECOMBES ;

董双林 .

水生生物学报, 2003, (06) :596-601

[3] 从灭活病毒诱导的培养细胞中鉴定鱼类抗病毒相关基因 [J].

张义兵 ;

张奇亚 ;

徐德全 ;

胡成钰 ;

桂建芳 .

科学通报, 2003, (05) :457-463

[4] 草鱼干扰素的体外诱生及其组织细胞的来源 [J].

邵健忠 ;

项黎新 .

动物学报, 2001, (06) :677-683

[5] 草鱼干扰素的免疫调节功能 [J].

邵健忠 ;

项黎新 .

动物学报, 2001, (04) :404-411

[6] PHA体外诱导草鱼白细胞产生γ-干扰素的研究 [J].

邵健忠 ;

项黎新 .

海洋与湖沼, 2001, (02) :117-124

[7] Identification and characterization of Fugu orthologues of mammalian interleukin-12 subunits [J].

Yoshiura, Y ;

Kiryu, I ;

Fujiwara, A ;

Suetake, H ;

Suzuki, Y ;

Nakanishi, T ;

Ototake, M .

IMMUNOGENETICS, 2003, 55 (05) :296-306

[8]

Characterisation, expression and promoter analysis of an interleukin 10 homologue in the puffer fish, Fugu rubripes[J] . Jun Zou,Melody S. Clark,Chris J. Secombes.Immunogenetics . 2003 (5)

[9]

I-dentification of an interferon gamma homologue inFugu,Takifugu rubripes .2 ZOU J,YASUTOSHI Y,SECOMBES C J,et al. Fish&Shellfish Im-munlogy . 2004

← 1 →