五种热带水果乙烯受体基因的SNP分析

被引:16
作者
韩继成
方宣钧
机构
[1] 海南省农作物分子育种重点实验室
[2] 海南省热带农业资源开发利用研究所
关键词
热带水果; 乙烯受体基因; 单核苷酸多态性;
D O I
暂无
中图分类号
Q943 [植物细胞遗传学];
学科分类号
071007 ; 090102 ;
摘要
根据乙烯受体基因的保守序列设计引物 ,分别从荔枝、香蕉、木瓜、芒果和莲雾等五种热带水果的基因组DNA中克隆出的乙烯受体基因的保守序列 ,序列长度分别为 14 4 0bp、 14 4 1bp、 14 39bp、 14 4 0bp和 14 4 0bp ,序列分析表明 ,与栽培稻的ers基因相似性最高。五种热带水果乙烯受体基因保守序列存在明显的单核苷酸变异 ,在 19个核苷酸位点存在SNPs (singlenucleotidepolymorphisms) ,其中 12个SNPs存在于内含子中 ,7个SNPs存在于编码序列区。在编码序列区的SNPs ,荔枝与其他 4种热带水果相比具有较高的单核苷酸多态性 ,荔枝有 4个核苷酸的变异 ,其余 4种热带水果仅有一个核苷酸变异。编码区序列中的单核苷酸的改变 ,除了第 783位核苷酸的不同没有引起氨基酸改变外 ,其余均导致编码氨基酸的改变
引用
收藏
页码:72 / 81
页数:10
相关论文
共 4 条
  • [1] Heterologous expression of the Arabidopsis etr1-1 allele inhibits the senescence of carnation flowers
    Bovy, AG
    Angenent, GC
    Dons, HJM
    van Altvorst, AC
    [J]. MOLECULAR BREEDING, 1999, 5 (04) : 301 - 308
  • [2] Ethylene receptor expression is regulated during fruit ripening, flower senescence and abscission[J] . Sharon Payton,Rupert G. Fray,Stephen Brown,Don Grierson.Plant Molecular Biology . 1996 (6)
  • [3] The mRNA for an ETR1 homologue in tomato is constitutively expressed in vegetative and reproductive tissues
    Zhou, DB
    Kalaitzis, P
    Mattoo, AK
    Tucker, ML
    [J]. PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 1996, 30 (06) : 1331 - 1338
  • [4] A rapid method for extraction of cotton ( Gossypium spp.) genomic DNA suitable for RFLP or PCR analysis[J] . Andrew H. Paterson,Curt L. Brubaker,Jonathan F. Wendel.Plant Molecular Biology Reporter . 1993 (2)