水稻单核苷酸多态性及其应用

被引：27

作者：

刘传光 ^{[1
]}

张桂权 ^{[2
]}

机构：

[1] 广东省农业科学院水稻所

[2] 华南农业大学农学院

来源：

遗传 | 2006年 / 06期

关键词：

单核苷酸多态性; 水稻; 基因分型; 遗传育种;

D O I：

10.16288/j.yczz.2006.06.018

中图分类号：

S511 [稻];

学科分类号：

摘要：

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)在水稻中数量多,分布密度高,最高SNPs数量可达80 127个,每154个碱基就存在一个SNP,平均SNP频率为0.65%左右。SNPs水稻亚种内品种间也很丰富,亲缘关系近的品种(或品系)间,即使用其他传统的分子标记方法难以找到多态性位点,用SNPs标记法也能找到数量可观的多态性位点。水稻SNP频率在各染色体间存在显著差异,而且在每条染色体上的分布也不均匀,存在明显的SNPs富集区域和稀缺区域。水稻SNPs的发现方法主要有对样本DNA的PCR产物直接测序、从SSR区段检测SNPs,以及从基因组序列和EST数据库直接搜索等。目前已有多种基因分型(genotyping)技术运用到了水稻SNPs检测,SNPs检测的高度自动化使水稻SNPs基因分型非常方便,SNPs检测还可以转化为CAPS(或dCAPS)标记或等位基因特异的PCR标记进行SNPs的基因分型。单核苷酸多态性在水稻遗传图谱的构建、基因克隆和功能基因组学研究、标记辅助选择育种、遗传资源分类及物种进化等方面的应用具有巨大潜力。

引用

页码：737 / 744

页数：8

共 8 条

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