我国西南地区玉米地方品种遗传多样性的SSR分子标记分析(英文)

被引:28
作者
姚启伦
杨克诚
潘光堂
荣廷昭
机构
[1] 四川农业大学玉米研究所
关键词
遗传多样性; 玉米地方品种; SSR标记;
D O I
暂无
中图分类号
S513 [玉米(玉蜀黍)];
学科分类号
摘要
利用微卫星(SSR)标记技术和DNA混合取样方法,选取均匀覆盖玉米染色体组的42对SSR引物,检测了来自我国西南地区54个玉米地方品种的遗传多样性。在54个玉米地方品种中检测到256个等位基因,每个SSR标记的等位基因数为2~9个,平均6.1个,说明我国西南地区玉米地方品种遗传多样性丰富。根据遗传相似系数矩阵做出的树状图,将54个玉米地方品种大致划分成4类,来源于同一地区的多数玉米地方品种划分在同一类中,表明西南地区玉米地方品种的地理分布与其遗传背景存在内在联系。从54个玉米地方品种中选出11个,每个品种选取15个单株,共165个DNA单株样品,分析玉米地方品种的遗传结构及其品种内的遗传多样性。对于检测玉米地方品种的遗传多样性,DNA单株样品分析优于DNA混合样品分析,42对相同的SSR引物在11个玉米地方品种中检测到330个等位基因,平均等位基因数A=7.86,有效等位基因数Ae=3.90,平均期望杂合度He=0.69,实际观察杂合度H0=0.37。据遗传结构分析结果,固定指数(F)为0.25~0.79,表明玉米地方品种是典型的混合繁育系统;由于杂合体不足,玉米地方品种群体间及群体内的遗传结构均偏离了Hardy-Weinberg平衡;杂合性基因多样度比率(Fst)平均为0.07,表明品种间和品种内的遗传变异分别占总遗传变异的7%和93%。玉米地方品种内遗传多样性及品种间遗传距离分析结果表明,在我国西南地区,分布在四川的玉米地方品种具有最丰富的遗传变异。经综合分析推测,我国西南地区玉米地方品种最早引进到四川种植,由此向毗邻地区传播扩散。
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作物学报, 2005, (07) :858-863
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作物学报, 2004, (01) :36-42
[3]  
Variation of DNA fingerprints among accessions within maize inbred lines and implications for identification of essentially derived varieties[J] . Martin Heckenberger,Martin Bohn,Janet S. Ziegle,Larry K. Joe,Joan D. Hauser,Michelle Hutton,Albrecht E. Melchinger.Molecular Breeding . 2002 (4)
[4]   Evaluation of a DNA pooled-sampling strategy for estimating the RFLP diversity of maize populations [J].
Dubreuil, P ;
Rebourg, C ;
Merlino, M ;
Charcosset, A .
PLANT MOLECULAR BIOLOGY REPORTER, 1999, 17 (02) :123-138
[5]  
An evaluation of the utility of SSR loci as molecular markers in maize (Zea mays L.): comparisons with data from RFLPS and pedigree[J] . J. S. C. Smith,E. C. L. Chin,H. Shu,O. S. Smith,S. J. Wall,M. L. Senior,S. E. Mitchell,S. Kresovich,J. Ziegle.TAG Theoretical and Applied Genetics . 1997 (1-2)
[6]   A comparative analysis of the genetic relationships between rye cultivars using RFLP and RAPD markers [J].
Loarce, Y ;
Gallego, R ;
Ferrer, E .
EUPHYTICA, 1996, 88 (02) :107-115
[7]  
Cluster analysis of local maize (Zea mays L.) germplasm in Sichuan based on SSRs. Liu SJ,Rong TZ,Yang JP,Pan GT. Acta Agronomica . 2004