一株芽孢杆菌16SrRNA的基因序列测定和系统进化分析

被引:12
作者
李瑞芳
赵玉峰
薛雯雯
田泱源
张长付
机构
[1] 河南工业大学生物工程学院
关键词
芽孢杆菌; 16SrDNA; 基因测序; 系统进化分析;
D O I
10.16768/j.issn.1004-874x.2011.03.001
中图分类号
S182 [农业微生物学];
学科分类号
09 ;
摘要
从河南黄河稻区土壤中分离出一株具有较强稻瘟病菌拮抗活性的芽孢杆菌菌株BS501,经过形态观察、生理生化特性检测和电镜技术,确定其为芽孢杆菌属细菌。为进一步确定其分类学地位,扩增了BS501基因组的16S rDNA,并将测序结果提交GenBank数据库(登录号:FJ755787)。利用BLAST软件将该序列与枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌等芽孢菌属细菌及大肠杆菌16S rDNA序列进行同源性比对。系统进化树表明,BS501与芽孢菌属细菌在进化关系上组成一个大的分支,与枯草芽孢杆菌最为接近,与大肠杆菌较远。同源性分析表明该序列与枯草芽孢杆菌PRE23同源性达99%,证实该菌株的分类学地位为枯草芽孢杆菌。
引用
收藏
页码:121 / 122+125 +125
页数:3
相关论文
共 8 条
[1]   一株具有纤维素降解能力的链霉菌LLJ-03的鉴定及初步研究 [J].
李路军 ;
游银伟 ;
任鹏飞 ;
宫志远 ;
李世国 .
西南农业学报, 2010, 23 (04) :1253-1256
[2]   应用RFLP和DGGE技术对沼气池中产甲烷菌多样性的研究 [J].
徐彦胜 ;
阮志勇 ;
刘小飞 ;
胡国全 .
西南农业学报, 2010, 23 (04) :1319-1324
[3]   具有稻瘟病菌拮抗活性的枯草芽孢杆菌的分离与鉴定 [J].
李瑞芳 ;
赵玉峰 ;
魏建 ;
薛雯雯 ;
刘冰 .
河南农业科学, 2010, (03) :63-66
[4]   1株来自陕西盐湖的极端嗜盐古菌的分离及鉴定 [J].
赵萍 ;
邹正中 ;
王革娇 .
华中农业大学学报, 2009, 28 (05) :573-576
[5]   副鸡嗜血杆菌的分离鉴定 [J].
马艳平 ;
张杰 ;
陈豪泰 ;
马丽娜 ;
丁耀忠 ;
杨生海 ;
刘永生 .
西南农业学报, 2009, 22 (03) :834-837
[6]   绵羊附红细胞体部分16S rRNA基因序列测定和系统进化分析 [J].
何立雄 ;
黄新 ;
杨华 ;
张云峰 ;
郑金海 ;
周建国 ;
徐雪平 ;
钟发刚 .
中国人兽共患病学报, 2009, 25 (06) :523-527
[7]   一株耐高温放线菌的分类研究 [J].
吴翔 ;
陈强 .
西南农业学报, 2009, 22 (02) :525-527
[8]   产淀粉酶枯草芽孢杆菌的16SrRNA测序鉴定 [J].
郭凤莲 ;
陈存社 .
中国酿造, 2007, (08) :26-28