基于分子参数的CYP2C9抑制剂的预测模型

被引:4
作者
李兰婷 [1 ]
李燕 [1 ]
王永华 [2 ]
张述伟 [1 ]
杨凌 [3 ]
机构
[1] 大连理工大学化工学院化学工艺教研室
[2] 大连水产学院生命科学与技术学院
[3] 中国科学院大连化学物理研究所药用资源开发研究组
关键词
细胞色素P450 2C9; 分子参数; 逐步判别分析; K-均值聚类分析;
D O I
10.16866/j.com.app.chem2007.07.021
中图分类号
R91 [药物基础科学];
学科分类号
1007 ;
摘要
细胞色素P4502C9(cytochrome P4502C9,CYP2C9)是肝脏重要的一种异物质代谢酶,许多药物或化学物质均可抑制和干扰其活性,在某种药物发现早期,预测基于CYP2C9抑制的药-药相互作用对筛选及发现新药具有重要意义。本文旨在建立CYP2C9抑制剂的预测模型,并确定抑制剂和非抑制剂显著不同的参数。选择81个化合物作为数据集,随机选其中64个为训练集,其余为验证集;选取250个分子参数给化合物数字化。采用逐步判别分析法(stepwise discriminant analysis method)和K-均值聚类分析法(K-Means cluster analysis method)模拟,建立数学模型,并用验证集检验模型的预测能力。结果表明:训练集的抑制剂正确率为96.4%,非抑制剂为97.2%;验证集的抑制剂正确率为85.7%,非抑制剂为90.0%。而采用K-均值聚类法时,抑制剂和非抑制剂的正确率也分别达到了82.9%和86.9%。对结果的深入分析找出对该模型贡献较大的参数为分子中氨基、烯基基团电拓扑状态指数、碳环数量以及疏水性参数,那些参数对区分抑制剂和非抑制剂两种结构差异、帮助指导CYP2C9抑制剂的筛选和发现具有重要意义。
引用
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