用CTAB法提取怀地黄嫩叶DNA,进行简单重复间序列标记 ISSR 分析.通过单因子实验分别研究了退火温度、Taq酶单位、Mg2+浓度、dNTP浓度、引物浓度和模板DNA浓度对ISSR-PCR反应的影响,找出各自的合适条件,而且每一个合适条件确定以后都被作为后续研究的一个条件.通过各个因子的组合研究建立了适宜于怀地黄ISSR分析的扩增体系:25μLPCR反应体积,1×TaqDNA酶缓冲液 10mmol/LTris-HCl,50mmol/LKCl,0.1%TrionX-100,pH9.0 ,2.5mmol/LMgCl2,1.5~1.0UTaq酶,60ng模板DNA,0.4μmmol/L引物,各0.4mmol/L的dATP、dGTP、dCTP和dTTP.合适的退火温度为53~55℃.为用ISSR技术分析鉴定怀地黄种质资源奠定了良好的基础.