海南岛两株甲病毒基因组3′末端核苷酸序列的克隆与分析

被引:27
作者
赵文忠
周国林
何海怀
付士红
金奇
赵春生
方美玉
蒋廉华
林立辉
梁国栋
侯云德
机构
[1] 广州军区医学研究所,中国预防医学科学院病毒学研究所病毒基因工程重点实验室,中国预防医学科学院病毒学研究所病毒基因工程重点实验室,中国预防医学科学院病毒学研究所病毒基因工程重点实验室,中国预防医学科学院病毒学研究所病毒基因工程重点实验室,广州军区医学研究所,广州
关键词
甲病毒属; 罗斯河病毒; 鹭山病毒; 克隆; 分子生物学; 碱基序列;
D O I
暂无
中图分类号
R373 [人体病毒学(致病病毒)];
学科分类号
摘要
目的 从分子水平鉴定海南省分离的两株甲病毒 (HBb17和M1病毒 )。方法 采用RT-PCR方法 ,分别扩增两株病毒基因组的 3′末端核苷酸序列 ,扩增产物经亚克隆 ,筛选重组子并测定核苷酸序列对序列进行分析。结果 HBb17和M1病毒分别扩增出约 1 6kb和 1 3kb的特异片段。序列分析表明 ,在 3′末端非翻译区HBb17病毒与罗斯河病毒 (国际标准株T48病毒 )核苷酸同源性为99 % ,M1病毒与鹭山病毒 (SAG)同源性为 98% ;两病毒结构基因的E1区序列 ,HBb17病毒与罗斯河病毒核苷酸 (氨基酸 )同源性为 99% (99% ) ,M1病毒与鹭山病毒核苷酸 (氨基酸 )同源性为 97% (99% ) ,M1病毒与盖塔病毒同源性为 94% (98% )。结论 序列分析表明 ,海南岛分离的HBb17病毒属于罗斯河病毒 ,M1病毒可能是鹭山病毒或盖塔病毒的变异株
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