精细定位和克隆9p21-22区域内鼻咽癌候选抑瘤基因

被引:28
作者
阳剑波
宾亮华
李忠花
张小慧
钱骏
张必成
周鸣
谢奕
邓龙文
李桂源
机构
[1] 湖南医科大学肿瘤研究所!湖南长沙,湖南医科大学肿瘤研究所!湖南长沙,湖南医科大学肿瘤研究所!湖南长沙,湖南医科大学肿瘤研究所!湖南长沙,湖南医科大学肿瘤研究所!湖南长沙,湖南医科大学肿瘤研究所!湖南长沙,湖南医科大学肿瘤研究
关键词
鼻咽癌; 染色体9p21-22; 杂合性丢失; 抑瘤基因; 克隆;
D O I
暂无
中图分类号
R739.63 [咽肿瘤];
学科分类号
摘要
目的:进一步精细限定鼻咽癌9p21-22区域等位基因杂合性丢失的频率和范围,筛选和克隆其共同缺失区内鼻咽癌相关的候选抑瘤基因。方法:应用11个定位于 9p21-22区域的高密度微卫星位点,检测 25例低分化鼻咽癌患者的杂合性丢失,确定其共同缺失区;用RT-PCR和Northern筛出在鼻咽癌细胞株HNE1和鼻咽癌活检组织中表达下调的、定位于共同缺失区内的 3’末端ESTs(Express Sequence Tags);采用 RACE技术和生物信息学资源克隆出候选EST的全长cDNA。结果: 25例患者中有17例(68%)存在一个或多个位点的杂合性丢失,其中D9s161(35.0%,7/20),D9S1678(31.5%,6/19),D9S263(3.3%,6/18)和D9S1853(33.3%,7/21)四个紧邻位点的丢失频率相对较高,并发现六位患者在该四个位点表现为连续性缺失;筛选D9S161-D9S1853区域内25个代表新基因的3’末端ESTs序列,发现一个EST(dbEST:208825)在鼻咽癌细胞株HNE1及73%(11/15)的活检组织中表达降低, Multiple Tissue Nort hem(MTN
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