牦牛MT-Ⅰ/-Ⅱ cDNA分子克隆及其蛋白质结构分析

被引:5
作者
马彬云
任宏伟
吴建平
徐明旭
张利平
向云
贺鹏飞
蔡欣
机构
[1] 甘肃农业大学动物科学技术学院
[2] 北京大学蛋白质工程国家重点实验室
[3] 北京大学人类疾病基因研究中心
[4] 北京师范大学生命科学学院
[5] 西北农林科技大学生命科学学院 兰州
[6] 北京
[7] 兰州
[8] 杨陵
关键词
牦牛; 金属硫蛋白; cDNA; 分子克隆; 结构预测;
D O I
10.13523/j.cb.20050414
中图分类号
S823.85 [];
学科分类号
0905 ;
摘要
利用基因特异引物YMTSP1和YMTSP2,通过RT-PCR从牦牛肝脏组织RNA中克隆出了牦牛 MT-Ⅰ(Genbank Accession No:AY513744)和MT-Ⅱ(Genbank Accession No:AY513745)基因编码区全 长。将牦牛MT-Ⅰ和MT-Ⅱ cDNA序列在CBI上进行同源性搜索发现,牦牛MT-Ⅰ/-Ⅱ编码区序列在 不同哺乳动物中相当保守。牦牛MT-Ⅰ和MT-Ⅱ编码的MT-Ⅰ和MT-Ⅱ蛋白分别由61个氨基酸组 成,其具有保守的短肽结构如:C-X-C,C-C-X-C-C,C-X-X-C等,其决定MT蛋白分子的整个三维结 构,在分子进化上十分保守。同时对牦牛MT的疏水性和跨膜区分析表明,牦牛MT蛋白可能不 存在跨膜区,也不存在信号肽,是1种非分泌蛋白。并通过同源比较模建,预测和构建了牦牛 MT-Ⅰ和MT-Ⅱ蛋白的分子空间结构,表明牦牛MT-Ⅰ和MT-Ⅱ由α-和β-两个结构域组成,在α-结构 域含有5个Cys短肽结构,β-结构域有4个Cys短肽结构,且2个结构域由保守的三肽序列KKS 相连。
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