鸡MHC B-LBⅡ新等位基因检测及多态性研究

被引：7

作者：

徐日福 ^{[1
]}

李奎 ^{[1
]}

陈国宏 ^{[2
]}

强巴央宗 ^{[3
]}

莫德林 ^{[1
]}

李长春 ^{[1
]}

樊斌 ^{[1
]}

刘榜 ^{[1
]}

机构：

[1] 华中农业大学动物科技学院分子生物学与动物育种教研室

[2] 扬州大学动物科技学院

[3] 西藏大学农牧学院畜牧兽医系

来源：

畜牧兽医学报 | 2005年 / 12期

关键词：

等位基因; 中国地方鸡种; B-LBⅡ基因; 多态性;

D O I：

暂无

中图分类号：

S831 [鸡];

学科分类号：

摘要：

在鸡的基因组中扩增了MHCB-LBⅡ基因第2外显子长度为374bp的片段,通过克隆、测序,发现了20个B-LBⅡ新等位基因。对第2外显子6个限制性酶切位点（AluⅠ、CaiⅠ、CfrⅠ、Hin1Ⅰ、HinfⅠ和RsaⅠ）的PCR-RFLP多态性进行分析,并运用在这6个位点所观测的纯合基因型组合对B-LBⅡ等位基因进行初步检测,结果显示,该方法的等位基因检出率可达65%,等位基因主型检出率为68.75%。对B-LBⅡ基因7个单倍型和20个等位基因第2外显子多态性分析表明,核苷酸的多态变异位点为63个,其中简约性信息位点48个,单变异位点15个;仅在中国地方鸡种所检测到的简约性信息位点13个,单变异位点11个。序列同源性达90.6%99.5%;核苷酸异义替换率为14.64%±2.67%,高于同义替换率2.92%±0.94%。为鸡B-LBⅡ基因多态性进化机制研究提供了参考资料。

引用

页码：1247 / 1255

页数：9

共 5 条

[1] 中国部分地方鸡种B-LⅡβ（β1外显子）基因分子遗传多态性研究
习欠云
李宁
唐玉新
孟庆勇
袁立
吴常信
[J]. 遗传学报, 2001, (01) : 7 - 14
[2] The major and a minor class II β-chain (B-LB) gene flank the Tapasin gene in the B-F/B-L region of the chicken major histocompatibility complex
Jacob, JP
Milne, S
Beck, S
Kaufman, J
[J]. IMMUNOGENETICS, 2000, 51 (02) : 138 - 147
[3] A POLYMORPHIC SYSTEM RELATED TO BUT GENETICALLY INDEPENDENT OF THE CHICKEN MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX
BRILES, WE
GOTO, RM
AUFFRAY, C
MILLER, MM
[J]. IMMUNOGENETICS, 1993, 37 (06) : 408 - 414
[4] Balancing selection: The major histocompatibility complex in adaptive evolution of genes and genomes. Hughes AL. Oxford University Press . 1999
[5] Chickenmajor histocompatibility complex class II B genes:a-nalysis of interallelic and interlocus sequence variance. Zoorob R,Bernot A,Renoir D M,et al. European Journal of Immunology . 1993

← 1 →