菌落PCR在大规模基因组测序中的应用

被引:24
作者
唐晔盛
李英
朱静洁
胡欣
林志新
韩斌
洪国藩
机构
[1] 上海交通大学生命科学技术学院
[2] 中国科学院国家基因研究中心
关键词
菌落PCR; 水稻基因组; 测序;
D O I
暂无
中图分类号
Q523 [脱氧核糖核酸(DNA)];
学科分类号
摘要
一种利用菌落直接PCR扩增DNA并用于测序的实验方法 .通过对引物的设计和菌液浓度控制 ,使PCR反应后的内容物对测序干扰减到最小 .与传统的测序过程比较 ,它省去了抽提模板DNA一步 ,节省了大量时间和实验成本 .另外此方法可对BAC亚克隆库构建时由连接转化过程中导致的假阳性起筛选和鉴定作用 .采用该法成功测定了籼稻 (Oryzasativaindica)广陆矮 4号的L3173号BACDNA全长序列 (约 10 0kb) ,GenBank登录号 :AL5 12 5 42 .
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共 4 条
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[2]  
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[3]  
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[4]  
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